Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKP1P63208 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKP1P63208 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SKP1P63208 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKP1P63208 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKP1P63208 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKP1P63208 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKP1P63208 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKP1P63208 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKP1P63208 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP1P63208 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKP1P63208 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKP1P63208 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKP1P63208 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKP1P63208 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKP1P63208 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKP1P63208 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP1P63208 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP1P63208 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP1P63208 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP1P63208 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP1P63208 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKP1P63208 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKP1P63208 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKP1P63208 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKP1P63208 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKP1P63208 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKP1P63208 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKP1P63208 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKP1P63208 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKP1P63208 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKP1P63208 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKP1P63208 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP1P63208 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKP1P63208 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKP1P63208 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKP1P63208 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKP1P63208 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP1P63208 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP1P63208 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP1P63208 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP1P63208 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKP1P63208 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP1P63208 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP1P63208 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP1P63208 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP1P63208 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP1P63208 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP1P63208 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP1P63208 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP1P63208 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP1P63208 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP1P63208 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKP1P63208 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKP1P63208 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKP1P63208 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKP1P63208 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKP1P63208 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKP1P63208 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKP1P63208 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP1P63208 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.3 ms