RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441349.5

ANKRD53-203, Transcript of ankyrin repeat domain 53, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD53, Length 1,797 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53-203ENST00000441349 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.35■■■■■ 6.77
ANKRD53-203ENST00000441349 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.76■■■■■ 5.72
ANKRD53-203ENST00000441349 ABCC9O60706 1549 aa49.25■■■■■ 5.47
ANKRD53-203ENST00000441349 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
ANKRD53-203ENST00000441349 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.72■■■■■ 5.23
ANKRD53-203ENST00000441349 NACADO15069 1562 aa47.59■■■■■ 5.21
ANKRD53-203ENST00000441349 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.53■■■■■ 5.2
ANKRD53-203ENST00000441349 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.44■■■■■ 5.19
ANKRD53-203ENST00000441349 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.44■■■■■ 5.18
ANKRD53-203ENST00000441349 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.57■■■■■ 5.05
ANKRD53-203ENST00000441349 SCRIBQ14160 1630 aa46.41■■■■■ 5.02
ANKRD53-203ENST00000441349 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.26■■■■■ 5
ANKRD53-203ENST00000441349 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.15■■■■■ 4.98
ANKRD53-203ENST00000441349 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.11■■■■■ 4.97
ANKRD53-203ENST00000441349 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
ANKRD53-203ENST00000441349 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.79■■■■■ 4.76
ANKRD53-203ENST00000441349 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.67■■■■■ 4.74
ANKRD53-203ENST00000441349 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.58■■■■■ 4.73
ANKRD53-203ENST00000441349 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
ANKRD53-203ENST00000441349 SMARCA4P51532 1647 aa44.42■■■■■ 4.7
ANKRD53-203ENST00000441349 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
ANKRD53-203ENST00000441349 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.25■■■■■ 4.67
ANKRD53-203ENST00000441349 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
ANKRD53-203ENST00000441349 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.04■■■■■ 4.64
ANKRD53-203ENST00000441349 SMARCA2P51531 1590 aa43.97■■■■■ 4.63
ANKRD53-203ENST00000441349 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.95■■■■■ 4.63
ANKRD53-203ENST00000441349 NCAPD3P42695 1498 aa43.92■■■■■ 4.62
ANKRD53-203ENST00000441349 WIZO95785 1651 aa43.82■■■■■ 4.61
ANKRD53-203ENST00000441349 HMGXB3Q12766 1538 aa43.75■■■■■ 4.59
ANKRD53-203ENST00000441349 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.59
ANKRD53-203ENST00000441349 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
ANKRD53-203ENST00000441349 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.82■■■■■ 4.45
ANKRD53-203ENST00000441349 NESP48681 1621 aa42.79■■■■■ 4.44
ANKRD53-203ENST00000441349 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.69■■■■■ 4.42
ANKRD53-203ENST00000441349 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.66■■■■■ 4.42
ANKRD53-203ENST00000441349 CFTRP13569 1480 aa42.53■■■■■ 4.4
ANKRD53-203ENST00000441349 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.48■■■■■ 4.39
ANKRD53-203ENST00000441349 ERCC6Q03468 1493 aa42.37■■■■■ 4.37
ANKRD53-203ENST00000441349 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.35■■■■■ 4.37
ANKRD53-203ENST00000441349 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.3■■■■■ 4.36
ANKRD53-203ENST00000441349 PRDM2Q13029 1718 aa42.28■■■■■ 4.36
ANKRD53-203ENST00000441349 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.2■■■■■ 4.35
ANKRD53-203ENST00000441349 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.09■■■■■ 4.33
ANKRD53-203ENST00000441349 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
ANKRD53-203ENST00000441349 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.92■■■■■ 4.3
ANKRD53-203ENST00000441349 TRIM41Q8WV44 630 aa41.83■■■■■ 4.29
ANKRD53-203ENST00000441349 WDR62O43379 1518 aa41.79■■■■■ 4.28
ANKRD53-203ENST00000441349 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
ANKRD53-203ENST00000441349 ABCC8Q09428 1581 aa41.77■■■■■ 4.28
ANKRD53-203ENST00000441349 CUX2O14529 1486 aa41.72■■■■■ 4.27
ANKRD53-203ENST00000441349 TOPBP1Q92547 1522 aa41.58■■■■■ 4.25
ANKRD53-203ENST00000441349 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.56■■■■■ 4.24
ANKRD53-203ENST00000441349 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
ANKRD53-203ENST00000441349 CUX1P39880 1505 aa41.47■■■■■ 4.23
ANKRD53-203ENST00000441349 SYNJ1O43426 1573 aa41.38■■■■■ 4.22
ANKRD53-203ENST00000441349 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
ANKRD53-203ENST00000441349 TOP2BQ02880 1626 aa41.26■■■■■ 4.19
ANKRD53-203ENST00000441349 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.24■■■■■ 4.19
ANKRD53-203ENST00000441349 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.24■■■■■ 4.19
ANKRD53-203ENST00000441349 IFT140Q96RY7 1462 aa41.16■■■■■ 4.18
ANKRD53-203ENST00000441349 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
ANKRD53-203ENST00000441349 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.1■■■■■ 4.17
ANKRD53-203ENST00000441349 SOGA1O94964 1423 aa41.07■■■■■ 4.17
ANKRD53-203ENST00000441349 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
ANKRD53-203ENST00000441349 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
ANKRD53-203ENST00000441349 WDR97A6NE52 1622 aa40.91■■■■■ 4.14
ANKRD53-203ENST00000441349 EEA1Q15075 1411 aa40.87■■■■■ 4.13
ANKRD53-203ENST00000441349 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
ANKRD53-203ENST00000441349 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.84■■■■■ 4.13
ANKRD53-203ENST00000441349 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
ANKRD53-203ENST00000441349 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.82■■■■■ 4.13
ANKRD53-203ENST00000441349 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
ANKRD53-203ENST00000441349 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.79■■■■■ 4.12
ANKRD53-203ENST00000441349 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.67■■■■■ 4.1
ANKRD53-203ENST00000441349 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.63■■■■■ 4.09
ANKRD53-203ENST00000441349 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.62■■■■■ 4.09
ANKRD53-203ENST00000441349 PBRM1Q86U86 1689 aa40.55■■■■■ 4.08
ANKRD53-203ENST00000441349 GRIN2BQ13224 1484 aa40.53■■■■■ 4.08
ANKRD53-203ENST00000441349 KIF27Q86VH2 1401 aa40.49■■■■■ 4.07
ANKRD53-203ENST00000441349 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.45■■■■■ 4.07
ANKRD53-203ENST00000441349 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.4■■■■■ 4.06
ANKRD53-203ENST00000441349 KIF21BO75037 1637 aa40.38■■■■■ 4.05
ANKRD53-203ENST00000441349 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
ANKRD53-203ENST00000441349 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.36■■■■■ 4.05
ANKRD53-203ENST00000441349 GOLGA3Q08378 1498 aa40.28■■■■■ 4.04
ANKRD53-203ENST00000441349 CHD1O14646 1710 aa40.27■■■■■ 4.04
ANKRD53-203ENST00000441349 ADAMTS12P58397 1594 aa40.24■■■■■ 4.03
ANKRD53-203ENST00000441349 IGF1RP08069 1367 aa40.23■■■■■ 4.03
ANKRD53-203ENST00000441349 SYNJ2O15056 1496 aa40.22■■■■■ 4.03
ANKRD53-203ENST00000441349 FBLN2P98095 1184 aa40.21■■■■■ 4.03
ANKRD53-203ENST00000441349 PRXQ9BXM0 1461 aa40.18■■■■■ 4.02
ANKRD53-203ENST00000441349 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
ANKRD53-203ENST00000441349 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.15■■■■■ 4.02
ANKRD53-203ENST00000441349 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.12■■■■■ 4.01
ANKRD53-203ENST00000441349 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.11■■■■■ 4.01
ANKRD53-203ENST00000441349 CUL7Q14999 1698 aa40.09■■■■■ 4.01
ANKRD53-203ENST00000441349 OSCARQ8IYS5 282 aa40.08■■■■■ 4.01
ANKRD53-203ENST00000441349 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
ANKRD53-203ENST00000441349 GRIN2AQ12879 1464 aa40.04■■■■■ 4
ANKRD53-203ENST00000441349 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.98■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms