RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.51■■■■■ 7.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.43■■■■■ 5.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NACADO15069 1562 aa50.22■■■■■ 5.63
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50■■■■■ 5.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.25■■■■■ 5.47
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.2■■■■■ 5.47
CAPNS1-204ENST00000587718 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.03■■■■■ 5.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SCRIBQ14160 1630 aa48.44■■■■■ 5.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.38■■■■■ 5.34
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.75■■■■■ 5.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.57■■■■■ 5.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NCAPD3P42695 1498 aa46.43■■■■■ 5.02
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CAPNS1-204ENST00000587718 SMARCA2P51531 1590 aa46.14■■■■■ 4.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.9■■■■■ 4.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.85■■■■■ 4.93
CAPNS1-204ENST00000587718 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 NESP48681 1621 aa45.52■■■■■ 4.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CUX2O14529 1486 aa45.4■■■■■ 4.86
CAPNS1-204ENST00000587718 WIZO95785 1651 aa45.27■■■■■ 4.84
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.24■■■■■ 4.83
CAPNS1-204ENST00000587718 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.81
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.04■■■■■ 4.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.02■■■■■ 4.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.86■■■■■ 4.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
CAPNS1-204ENST00000587718 CFTRP13569 1480 aa44.58■■■■■ 4.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.56■■■■■ 4.72
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR62O43379 1518 aa44.45■■■■■ 4.71
CAPNS1-204ENST00000587718 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.45■■■■■ 4.71
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.44■■■■■ 4.7
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.27■■■■■ 4.68
CAPNS1-204ENST00000587718 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PRDM2Q13029 1718 aa43.99■■■■■ 4.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TOPBP1Q92547 1522 aa43.66■■■■■ 4.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC8Q09428 1581 aa43.59■■■■■ 4.57
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT140Q96RY7 1462 aa43.57■■■■■ 4.56
CAPNS1-204ENST00000587718 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.5■■■■■ 4.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
CAPNS1-204ENST00000587718 OSCARQ8IYS5 282 aa43.43■■■■■ 4.54
CAPNS1-204ENST00000587718 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
CAPNS1-204ENST00000587718 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 SOGA1O94964 1423 aa43.06■■■■■ 4.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.01■■■■■ 4.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR97A6NE52 1622 aa42.8■■■■■ 4.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CHD1O14646 1710 aa42.76■■■■■ 4.44
CAPNS1-204ENST00000587718 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.75■■■■■ 4.43
CAPNS1-204ENST00000587718 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.75■■■■■ 4.43
CAPNS1-204ENST00000587718 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.75■■■■■ 4.43
CAPNS1-204ENST00000587718 FBLN2P98095 1184 aa42.72■■■■■ 4.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF11O15085 1522 aa42.69■■■■■ 4.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.69■■■■■ 4.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.67■■■■■ 4.42
CAPNS1-204ENST00000587718 GRIN2BQ13224 1484 aa42.63■■■■■ 4.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.53■■■■■ 4.4
CAPNS1-204ENST00000587718 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
CAPNS1-204ENST00000587718 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNJ2O15056 1496 aa42.45■■■■■ 4.39
CAPNS1-204ENST00000587718 TOP2BQ02880 1626 aa42.44■■■■■ 4.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.44■■■■■ 4.38
CAPNS1-204ENST00000587718 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.42■■■■■ 4.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 SYNJ1O43426 1573 aa42.39■■■■■ 4.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.38■■■■■ 4.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.37■■■■■ 4.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ARAP1Q96P48 1450 aa42.31■■■■■ 4.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.02■■■■■ 4.32
CAPNS1-204ENST00000587718 NUP160Q12769 1436 aa41.97■■■■■ 4.31
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP170Q5SW79 1584 aa41.9■■■■■ 4.3
CAPNS1-204ENST00000587718 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.75■■■■■ 4.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SHROOM2Q13796 1616 aa41.7■■■■■ 4.27
CAPNS1-204ENST00000587718 IGF1RP08069 1367 aa41.65■■■■■ 4.26
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF27Q86VH2 1401 aa41.63■■■■■ 4.25
CAPNS1-204ENST00000587718 JPH4Q96JJ6 628 aa41.54■■■■■ 4.24
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