RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566954.1

BX255925.1-201, humanhuman

BASIC

Gene BX255925.1, Length 1,854 nt, Biotype sense overlapping.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BX255925.1-201ENST00000566954 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.59■■■■■ 6.65
BX255925.1-201ENST00000566954 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.54■■■■■ 5.52
BX255925.1-201ENST00000566954 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
BX255925.1-201ENST00000566954 ABCC9O60706 1549 aa47.38■■■■■ 5.18
BX255925.1-201ENST00000566954 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.96■■■■■ 5.11
BX255925.1-201ENST00000566954 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.79■■■■■ 5.08
BX255925.1-201ENST00000566954 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.44■■■■■ 5.03
BX255925.1-201ENST00000566954 NACADO15069 1562 aa46.31■■■■■ 5
BX255925.1-201ENST00000566954 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.04■■■■■ 4.96
BX255925.1-201ENST00000566954 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.94■■■■■ 4.95
BX255925.1-201ENST00000566954 SCRIBQ14160 1630 aa45.51■■■■■ 4.88
BX255925.1-201ENST00000566954 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.03■■■■■ 4.8
BX255925.1-201ENST00000566954 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.65■■■■■ 4.74
BX255925.1-201ENST00000566954 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.6■■■■■ 4.73
BX255925.1-201ENST00000566954 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
BX255925.1-201ENST00000566954 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.01■■■■■ 4.64
BX255925.1-201ENST00000566954 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
BX255925.1-201ENST00000566954 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
BX255925.1-201ENST00000566954 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.69■■■■■ 4.58
BX255925.1-201ENST00000566954 SMARCA4P51532 1647 aa43.59■■■■■ 4.57
BX255925.1-201ENST00000566954 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
BX255925.1-201ENST00000566954 WIZO95785 1651 aa43.28■■■■■ 4.52
BX255925.1-201ENST00000566954 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.09■■■■■ 4.49
BX255925.1-201ENST00000566954 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.04■■■■■ 4.48
BX255925.1-201ENST00000566954 SMARCA2P51531 1590 aa43■■■■■ 4.47
BX255925.1-201ENST00000566954 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.89■■■■■ 4.46
BX255925.1-201ENST00000566954 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.85■■■■■ 4.45
BX255925.1-201ENST00000566954 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
BX255925.1-201ENST00000566954 NCAPD3P42695 1498 aa42.77■■■■■ 4.44
BX255925.1-201ENST00000566954 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
BX255925.1-201ENST00000566954 HMGXB3Q12766 1538 aa42.65■■■■■ 4.42
BX255925.1-201ENST00000566954 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.41■■■■■ 4.38
BX255925.1-201ENST00000566954 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.3■■■■■ 4.36
BX255925.1-201ENST00000566954 TRIM41Q8WV44 630 aa41.82■■■■■ 4.29
BX255925.1-201ENST00000566954 CFTRP13569 1480 aa41.67■■■■■ 4.26
BX255925.1-201ENST00000566954 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.65■■■■■ 4.26
BX255925.1-201ENST00000566954 NESP48681 1621 aa41.43■■■■■ 4.22
BX255925.1-201ENST00000566954 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.38■■■■■ 4.21
BX255925.1-201ENST00000566954 ABCC8Q09428 1581 aa41.34■■■■■ 4.21
BX255925.1-201ENST00000566954 PRDM2Q13029 1718 aa41.33■■■■■ 4.21
BX255925.1-201ENST00000566954 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.21■■■■■ 4.19
BX255925.1-201ENST00000566954 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.17■■■■■ 4.18
BX255925.1-201ENST00000566954 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
BX255925.1-201ENST00000566954 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.12■■■■■ 4.17
BX255925.1-201ENST00000566954 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
BX255925.1-201ENST00000566954 SYNJ1O43426 1573 aa40.97■■■■■ 4.15
BX255925.1-201ENST00000566954 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.96■■■■■ 4.15
BX255925.1-201ENST00000566954 CUX1P39880 1505 aa40.89■■■■■ 4.14
BX255925.1-201ENST00000566954 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.88■■■■■ 4.13
BX255925.1-201ENST00000566954 TOP2BQ02880 1626 aa40.86■■■■■ 4.13
BX255925.1-201ENST00000566954 EEA1Q15075 1411 aa40.8■■■■■ 4.12
BX255925.1-201ENST00000566954 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.79■■■■■ 4.12
BX255925.1-201ENST00000566954 ERCC6Q03468 1493 aa40.69■■■■■ 4.1
BX255925.1-201ENST00000566954 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.67■■■■■ 4.1
BX255925.1-201ENST00000566954 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
BX255925.1-201ENST00000566954 TOPBP1Q92547 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
BX255925.1-201ENST00000566954 SOGA1O94964 1423 aa40.65■■■■■ 4.1
BX255925.1-201ENST00000566954 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.58■■■■■ 4.09
BX255925.1-201ENST00000566954 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.52■■■■■ 4.08
BX255925.1-201ENST00000566954 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.46■■■■■ 4.07
BX255925.1-201ENST00000566954 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.43■■■■■ 4.06
BX255925.1-201ENST00000566954 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
BX255925.1-201ENST00000566954 WDR62O43379 1518 aa40.38■■■■■ 4.06
BX255925.1-201ENST00000566954 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.38■■■■■ 4.05
BX255925.1-201ENST00000566954 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
BX255925.1-201ENST00000566954 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.29■■■■■ 4.04
BX255925.1-201ENST00000566954 GOLGA3Q08378 1498 aa40.23■■■■■ 4.03
BX255925.1-201ENST00000566954 KIF21BO75037 1637 aa40.23■■■■■ 4.03
BX255925.1-201ENST00000566954 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.19■■■■■ 4.02
BX255925.1-201ENST00000566954 CUX2O14529 1486 aa40.18■■■■■ 4.02
BX255925.1-201ENST00000566954 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.17■■■■■ 4.02
BX255925.1-201ENST00000566954 KIF27Q86VH2 1401 aa40.17■■■■■ 4.02
BX255925.1-201ENST00000566954 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
BX255925.1-201ENST00000566954 WDR97A6NE52 1622 aa40.02■■■■■ 4
BX255925.1-201ENST00000566954 IFT140Q96RY7 1462 aa40.02■■■■■ 4
BX255925.1-201ENST00000566954 CEP162Q5TB80 1403 aa40■■■■□ 3.99
BX255925.1-201ENST00000566954 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
BX255925.1-201ENST00000566954 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
BX255925.1-201ENST00000566954 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.94■■■■□ 3.98
BX255925.1-201ENST00000566954 IGF1RP08069 1367 aa39.89■■■■□ 3.98
BX255925.1-201ENST00000566954 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
BX255925.1-201ENST00000566954 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.86■■■■□ 3.97
BX255925.1-201ENST00000566954 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.85■■■■□ 3.97
BX255925.1-201ENST00000566954 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.84■■■■□ 3.97
BX255925.1-201ENST00000566954 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.83■■■■□ 3.97
BX255925.1-201ENST00000566954 PRXQ9BXM0 1461 aa39.82■■■■□ 3.97
BX255925.1-201ENST00000566954 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.96
BX255925.1-201ENST00000566954 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.79■■■■□ 3.96
BX255925.1-201ENST00000566954 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.67■■■■□ 3.94
BX255925.1-201ENST00000566954 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
BX255925.1-201ENST00000566954 GRIN2BQ13224 1484 aa39.61■■■■□ 3.93
BX255925.1-201ENST00000566954 PBRM1Q86U86 1689 aa39.58■■■■□ 3.93
BX255925.1-201ENST00000566954 CLIP1P30622 1438 aa39.58■■■■□ 3.93
BX255925.1-201ENST00000566954 CUL7Q14999 1698 aa39.56■■■■□ 3.92
BX255925.1-201ENST00000566954 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
BX255925.1-201ENST00000566954 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.4■■■■□ 3.9
BX255925.1-201ENST00000566954 ADAMTS12P58397 1594 aa39.38■■■■□ 3.89
BX255925.1-201ENST00000566954 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
BX255925.1-201ENST00000566954 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.33■■■■□ 3.89
BX255925.1-201ENST00000566954 HRCP23327 699 aa39.29■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms