RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449228.5

BBC3-204, Transcript of BCL2 binding component 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BBC3, Length 1,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBC3-204ENST00000449228 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.31■■■■■ 6.6
BBC3-204ENST00000449228 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.09■■■■■ 5.45
BBC3-204ENST00000449228 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
BBC3-204ENST00000449228 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.58■■■■■ 5.05
BBC3-204ENST00000449228 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.58■■■■■ 5.05
BBC3-204ENST00000449228 ABCC9O60706 1549 aa46.4■■■■■ 5.02
BBC3-204ENST00000449228 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.04■■■■■ 4.96
BBC3-204ENST00000449228 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.94■■■■■ 4.95
BBC3-204ENST00000449228 NACADO15069 1562 aa45.75■■■■■ 4.91
BBC3-204ENST00000449228 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.36■■■■■ 4.85
BBC3-204ENST00000449228 SCRIBQ14160 1630 aa45.13■■■■■ 4.82
BBC3-204ENST00000449228 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.32■■■■■ 4.68
BBC3-204ENST00000449228 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
BBC3-204ENST00000449228 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.89■■■■■ 4.62
BBC3-204ENST00000449228 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.78■■■■■ 4.6
BBC3-204ENST00000449228 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.71■■■■■ 4.59
BBC3-204ENST00000449228 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
BBC3-204ENST00000449228 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
BBC3-204ENST00000449228 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.47■■■■■ 4.55
BBC3-204ENST00000449228 SMARCA4P51532 1647 aa43.27■■■■■ 4.52
BBC3-204ENST00000449228 WIZO95785 1651 aa43.11■■■■■ 4.49
BBC3-204ENST00000449228 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.74■■■■■ 4.43
BBC3-204ENST00000449228 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
BBC3-204ENST00000449228 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
BBC3-204ENST00000449228 SMARCA2P51531 1590 aa42.59■■■■■ 4.41
BBC3-204ENST00000449228 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.57■■■■■ 4.41
BBC3-204ENST00000449228 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
BBC3-204ENST00000449228 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.36■■■■■ 4.37
BBC3-204ENST00000449228 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.27■■■■■ 4.36
BBC3-204ENST00000449228 NCAPD3P42695 1498 aa42.22■■■■■ 4.35
BBC3-204ENST00000449228 HMGXB3Q12766 1538 aa42.16■■■■■ 4.34
BBC3-204ENST00000449228 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.98■■■■■ 4.31
BBC3-204ENST00000449228 TRIM41Q8WV44 630 aa41.67■■■■■ 4.26
BBC3-204ENST00000449228 ABCC8Q09428 1581 aa41.35■■■■■ 4.21
BBC3-204ENST00000449228 CFTRP13569 1480 aa41.29■■■■■ 4.2
BBC3-204ENST00000449228 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.16■■■■■ 4.18
BBC3-204ENST00000449228 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.185e-6■■■■■ 46
BBC3-204ENST00000449228 PRDM2Q13029 1718 aa41.03■■■■■ 4.16
BBC3-204ENST00000449228 SYNJ1O43426 1573 aa40.92■■■■■ 4.14
BBC3-204ENST00000449228 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
BBC3-204ENST00000449228 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.83■■■■■ 4.13
BBC3-204ENST00000449228 TOP2BQ02880 1626 aa40.79■■■■■ 4.12
BBC3-204ENST00000449228 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.79■■■■■ 4.12
BBC3-204ENST00000449228 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.73■■■■■ 4.11
BBC3-204ENST00000449228 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.72■■■■■ 4.11
BBC3-204ENST00000449228 NESP48681 1621 aa40.71■■■■■ 4.11
BBC3-204ENST00000449228 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.69■■■■■ 4.1
BBC3-204ENST00000449228 CUX1P39880 1505 aa40.65■■■■■ 4.1
BBC3-204ENST00000449228 EEA1Q15075 1411 aa40.64■■■■■ 4.1
BBC3-204ENST00000449228 SOGA1O94964 1423 aa40.61■■■■■ 4.09
BBC3-204ENST00000449228 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.52■■■■■ 4.08
BBC3-204ENST00000449228 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.45■■■■■ 4.07
BBC3-204ENST00000449228 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.41■■■■■ 4.06
BBC3-204ENST00000449228 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.39■■■■■ 4.06
BBC3-204ENST00000449228 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.32■■■■■ 4.04
BBC3-204ENST00000449228 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.26■■■■■ 4.03
BBC3-204ENST00000449228 TOPBP1Q92547 1522 aa40.23■■■■■ 4.03
BBC3-204ENST00000449228 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.23■■■■■ 4.03
BBC3-204ENST00000449228 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.21■■■■■ 4.03
BBC3-204ENST00000449228 KIF27Q86VH2 1401 aa40.15■■■■■ 4.02
BBC3-204ENST00000449228 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
BBC3-204ENST00000449228 GOLGA3Q08378 1498 aa40.04■■■■■ 4
BBC3-204ENST00000449228 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
BBC3-204ENST00000449228 KIF21BO75037 1637 aa40.03■■■■■ 4
BBC3-204ENST00000449228 CUX2O14529 1486 aa40■■■■□ 3.99
BBC3-204ENST00000449228 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.95■■■■□ 3.99
BBC3-204ENST00000449228 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.92■■■■□ 3.98
BBC3-204ENST00000449228 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
BBC3-204ENST00000449228 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.89■■■■□ 3.98
BBC3-204ENST00000449228 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.89■■■■□ 3.98
BBC3-204ENST00000449228 ERCC6Q03468 1493 aa39.86■■■■□ 3.97
BBC3-204ENST00000449228 PRXQ9BXM0 1461 aa39.83■■■■□ 3.97
BBC3-204ENST00000449228 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.79■■■■□ 3.96
BBC3-204ENST00000449228 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.78■■■■□ 3.96
BBC3-204ENST00000449228 IGF1RP08069 1367 aa39.74■■■■□ 3.95
BBC3-204ENST00000449228 WDR62O43379 1518 aa39.72■■■■□ 3.95
BBC3-204ENST00000449228 WDR97A6NE52 1622 aa39.69■■■■□ 3.94
BBC3-204ENST00000449228 CEP162Q5TB80 1403 aa39.68■■■■□ 3.94
BBC3-204ENST00000449228 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
BBC3-204ENST00000449228 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.58■■■■□ 3.93
BBC3-204ENST00000449228 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
BBC3-204ENST00000449228 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
BBC3-204ENST00000449228 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.53■■■■□ 3.92
BBC3-204ENST00000449228 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.51■■■■□ 3.91
BBC3-204ENST00000449228 IFT140Q96RY7 1462 aa39.49■■■■□ 3.91
BBC3-204ENST00000449228 CUL7Q14999 1698 aa39.45■■■■□ 3.91
BBC3-204ENST00000449228 CLIP1P30622 1438 aa39.39■■■■□ 3.9
BBC3-204ENST00000449228 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.27■■■■□ 3.882e-8■■■□□ 18.9
BBC3-204ENST00000449228 PBRM1Q86U86 1689 aa39.22■■■■□ 3.87
BBC3-204ENST00000449228 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
BBC3-204ENST00000449228 GRIN2BQ13224 1484 aa39.21■■■■□ 3.87
BBC3-204ENST00000449228 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
BBC3-204ENST00000449228 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.09■■■■□ 3.85
BBC3-204ENST00000449228 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
BBC3-204ENST00000449228 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.05■■■■□ 3.84
BBC3-204ENST00000449228 ADAMTS12P58397 1594 aa39.02■■■■□ 3.84
BBC3-204ENST00000449228 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.98■■■■□ 3.83
BBC3-204ENST00000449228 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
BBC3-204ENST00000449228 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.95■■■■□ 3.83
BBC3-204ENST00000449228 ARAP1Q96P48 1450 aa38.95■■■■□ 3.83
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