RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428771.6

HES4-202, Transcript of hes family bHLH transcription factor 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HES4, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES4-202ENST00000428771 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.96■■■■■ 7.35
HES4-202ENST00000428771 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.52■■■■■ 6.32
HES4-202ENST00000428771 ABCC9O60706 1549 aa53.76■■■■■ 6.2
HES4-202ENST00000428771 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.62■■■■■ 5.85
HES4-202ENST00000428771 NACADO15069 1562 aa51.45■■■■■ 5.83
HES4-202ENST00000428771 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.22■■■■■ 5.79
HES4-202ENST00000428771 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.98■■■■■ 5.75
HES4-202ENST00000428771 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
HES4-202ENST00000428771 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.51■■■■■ 5.68
HES4-202ENST00000428771 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.28■■■■■ 5.64
HES4-202ENST00000428771 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.14■■■■■ 5.62
HES4-202ENST00000428771 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.05■■■■■ 5.6
HES4-202ENST00000428771 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.89■■■■■ 5.58
HES4-202ENST00000428771 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.59■■■■■ 5.53
HES4-202ENST00000428771 SCRIBQ14160 1630 aa49.52■■■■■ 5.52
HES4-202ENST00000428771 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
HES4-202ENST00000428771 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.65■■■■■ 5.38
HES4-202ENST00000428771 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.45■■■■■ 5.35
HES4-202ENST00000428771 NCAPD3P42695 1498 aa47.45■■■■■ 5.19
HES4-202ENST00000428771 SMARCA4P51532 1647 aa47.39■■■■■ 5.18
HES4-202ENST00000428771 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.35■■■■■ 5.17
HES4-202ENST00000428771 SMARCA2P51531 1590 aa47.32■■■■■ 5.17
HES4-202ENST00000428771 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.3■■■■■ 5.16
HES4-202ENST00000428771 HMGXB3Q12766 1538 aa47.13■■■■■ 5.14
HES4-202ENST00000428771 PEG3Q9GZU2 1588 aa47■■■■■ 5.11
HES4-202ENST00000428771 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
HES4-202ENST00000428771 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.86■■■■■ 5.09
HES4-202ENST00000428771 ERCC6Q03468 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
HES4-202ENST00000428771 WIZO95785 1651 aa46.33■■■■■ 5.01
HES4-202ENST00000428771 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.3■■■■■ 5
HES4-202ENST00000428771 NESP48681 1621 aa46.28■■■■■ 5
HES4-202ENST00000428771 CUX2O14529 1486 aa46.27■■■■■ 5
HES4-202ENST00000428771 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.18■■■■■ 4.98
HES4-202ENST00000428771 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.1■■■■■ 4.97
HES4-202ENST00000428771 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.07■■■■■ 4.97
HES4-202ENST00000428771 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.03■■■■■ 4.96
HES4-202ENST00000428771 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
HES4-202ENST00000428771 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.78■■■■■ 4.92
HES4-202ENST00000428771 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.92
HES4-202ENST00000428771 CFTRP13569 1480 aa45.6■■■■■ 4.89
HES4-202ENST00000428771 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.52■■■■■ 4.88
HES4-202ENST00000428771 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.48■■■■■ 4.87
HES4-202ENST00000428771 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.44■■■■■ 4.87
HES4-202ENST00000428771 WDR62O43379 1518 aa45.36■■■■■ 4.85
HES4-202ENST00000428771 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.33■■■■■ 4.85
HES4-202ENST00000428771 PRDM2Q13029 1718 aa45.22■■■■■ 4.83
HES4-202ENST00000428771 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.78
HES4-202ENST00000428771 ABCC8Q09428 1581 aa44.82■■■■■ 4.77
HES4-202ENST00000428771 TOPBP1Q92547 1522 aa44.63■■■■■ 4.73
HES4-202ENST00000428771 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
HES4-202ENST00000428771 IFT140Q96RY7 1462 aa44.58■■■■■ 4.73
HES4-202ENST00000428771 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.56■■■■■ 4.72
HES4-202ENST00000428771 OSCARQ8IYS5 282 aa44.33■■■■■ 4.69
HES4-202ENST00000428771 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
HES4-202ENST00000428771 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
HES4-202ENST00000428771 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
HES4-202ENST00000428771 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
HES4-202ENST00000428771 SOGA1O94964 1423 aa44.09■■■■■ 4.65
HES4-202ENST00000428771 TRIM41Q8WV44 630 aa44.03■■■■■ 4.64
HES4-202ENST00000428771 CUX1P39880 1505 aa44.01■■■■■ 4.64
HES4-202ENST00000428771 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44■■■■■ 4.63
HES4-202ENST00000428771 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.99■■■■■ 4.636e-6■□□□□ 8.5
HES4-202ENST00000428771 WDR97A6NE52 1622 aa43.97■■■■■ 4.63
HES4-202ENST00000428771 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.96■■■■■ 4.63
HES4-202ENST00000428771 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
HES4-202ENST00000428771 FBLN2P98095 1184 aa43.69■■■■■ 4.58
HES4-202ENST00000428771 GRIN2BQ13224 1484 aa43.66■■■■■ 4.58
HES4-202ENST00000428771 CHD1O14646 1710 aa43.66■■■■■ 4.58
HES4-202ENST00000428771 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.63■■■■■ 4.57
HES4-202ENST00000428771 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
HES4-202ENST00000428771 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.61■■■■■ 4.57
HES4-202ENST00000428771 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.57■■■■■ 4.56
HES4-202ENST00000428771 TOP2BQ02880 1626 aa43.56■■■■■ 4.56
HES4-202ENST00000428771 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.56■■■■■ 4.56
HES4-202ENST00000428771 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
HES4-202ENST00000428771 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.55■■■■■ 4.56
HES4-202ENST00000428771 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.47■■■■■ 4.55
HES4-202ENST00000428771 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.47■■■■■ 4.55
HES4-202ENST00000428771 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.47■■■■■ 4.55
HES4-202ENST00000428771 SYNJ2O15056 1496 aa43.44■■■■■ 4.54
HES4-202ENST00000428771 PBRM1Q86U86 1689 aa43.43■■■■■ 4.54
HES4-202ENST00000428771 ARHGEF11O15085 1522 aa43.43■■■■■ 4.54
HES4-202ENST00000428771 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.41■■■■■ 4.54
HES4-202ENST00000428771 SYNJ1O43426 1573 aa43.4■■■■■ 4.54
HES4-202ENST00000428771 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.18■■■■■ 4.5
HES4-202ENST00000428771 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.14■■■■■ 4.5
HES4-202ENST00000428771 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.12■■■■■ 4.49
HES4-202ENST00000428771 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.06■■■■■ 4.48
HES4-202ENST00000428771 GRIN2AQ12879 1464 aa43.04■■■■■ 4.48
HES4-202ENST00000428771 ADAMTS12P58397 1594 aa43.03■■■■■ 4.48
HES4-202ENST00000428771 ARAP1Q96P48 1450 aa42.98■■■■■ 4.47
HES4-202ENST00000428771 NUP160Q12769 1436 aa42.88■■■■■ 4.45
HES4-202ENST00000428771 KIF27Q86VH2 1401 aa42.83■■■■■ 4.45
HES4-202ENST00000428771 CEP170Q5SW79 1584 aa42.76■■■■■ 4.44
HES4-202ENST00000428771 IGF1RP08069 1367 aa42.65■■■■■ 4.42
HES4-202ENST00000428771 CUL7Q14999 1698 aa42.61■■■■■ 4.41
HES4-202ENST00000428771 SHROOM2Q13796 1616 aa42.6■■■■■ 4.41
HES4-202ENST00000428771 JPH4Q96JJ6 628 aa42.53■■■■■ 4.4
HES4-202ENST00000428771 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
HES4-202ENST00000428771 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.42■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms