Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
AKIP1Q9NQ31 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
AKIP1Q9NQ31 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AKIP1Q9NQ31 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AKIP1Q9NQ31 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AKIP1Q9NQ31 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AKIP1Q9NQ31 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AKIP1Q9NQ31 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AKIP1Q9NQ31 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKIP1Q9NQ31 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
AKIP1Q9NQ31 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKIP1Q9NQ31 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKIP1Q9NQ31 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AKIP1Q9NQ31 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AKIP1Q9NQ31 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AKIP1Q9NQ31 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKIP1Q9NQ31 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
AKIP1Q9NQ31 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AKIP1Q9NQ31 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AKIP1Q9NQ31 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AKIP1Q9NQ31 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AKIP1Q9NQ31 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AKIP1Q9NQ31 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AKIP1Q9NQ31 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AKIP1Q9NQ31 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AKIP1Q9NQ31 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
AKIP1Q9NQ31 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AKIP1Q9NQ31 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AKIP1Q9NQ31 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKIP1Q9NQ31 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AKIP1Q9NQ31 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AKIP1Q9NQ31 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AKIP1Q9NQ31 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AKIP1Q9NQ31 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKIP1Q9NQ31 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKIP1Q9NQ31 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKIP1Q9NQ31 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AKIP1Q9NQ31 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AKIP1Q9NQ31 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AKIP1Q9NQ31 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AKIP1Q9NQ31 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AKIP1Q9NQ31 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AKIP1Q9NQ31 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AKIP1Q9NQ31 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AKIP1Q9NQ31 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKIP1Q9NQ31 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKIP1Q9NQ31 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKIP1Q9NQ31 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AKIP1Q9NQ31 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AKIP1Q9NQ31 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AKIP1Q9NQ31 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AKIP1Q9NQ31 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKIP1Q9NQ31 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKIP1Q9NQ31 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKIP1Q9NQ31 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKIP1Q9NQ31 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKIP1Q9NQ31 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKIP1Q9NQ31 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKIP1Q9NQ31 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AKIP1Q9NQ31 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AKIP1Q9NQ31 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AKIP1Q9NQ31 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKIP1Q9NQ31 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKIP1Q9NQ31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AKIP1Q9NQ31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AKIP1Q9NQ31 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AKIP1Q9NQ31 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AKIP1Q9NQ31 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AKIP1Q9NQ31 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AKIP1Q9NQ31 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKIP1Q9NQ31 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKIP1Q9NQ31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AKIP1Q9NQ31 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AKIP1Q9NQ31 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AKIP1Q9NQ31 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AKIP1Q9NQ31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AKIP1Q9NQ31 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AKIP1Q9NQ31 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AKIP1Q9NQ31 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AKIP1Q9NQ31 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AKIP1Q9NQ31 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AKIP1Q9NQ31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AKIP1Q9NQ31 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AKIP1Q9NQ31 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AKIP1Q9NQ31 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AKIP1Q9NQ31 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AKIP1Q9NQ31 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AKIP1Q9NQ31 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AKIP1Q9NQ31 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AKIP1Q9NQ31 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AKIP1Q9NQ31 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AKIP1Q9NQ31 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AKIP1Q9NQ31 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AKIP1Q9NQ31 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AKIP1Q9NQ31 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AKIP1Q9NQ31 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AKIP1Q9NQ31 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AKIP1Q9NQ31 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AKIP1Q9NQ31 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AKIP1Q9NQ31 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms