RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373709.7

SERINC2-201, Transcript of serine incorporator 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERINC2, Length 1,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2-201ENST00000373709 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.67■■■■■ 7.78
SERINC2-201ENST00000373709 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.02■■■■■ 6.56
SERINC2-201ENST00000373709 ABCC9O60706 1549 aa54.29■■■■■ 6.28
SERINC2-201ENST00000373709 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.25■■■■■ 6.12
SERINC2-201ENST00000373709 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.12■■■■■ 6.09
SERINC2-201ENST00000373709 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.5■■■■■ 5.99
SERINC2-201ENST00000373709 NACADO15069 1562 aa52.45■■■■■ 5.99
SERINC2-201ENST00000373709 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.34■■■■■ 5.97
SERINC2-201ENST00000373709 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.31■■■■■ 5.96
SERINC2-201ENST00000373709 SCRIBQ14160 1630 aa51.55■■■■■ 5.84
SERINC2-201ENST00000373709 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.37■■■■■ 5.81
SERINC2-201ENST00000373709 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.31■■■■■ 5.8
SERINC2-201ENST00000373709 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.97■■■■■ 5.75
SERINC2-201ENST00000373709 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.89■■■■■ 5.74
SERINC2-201ENST00000373709 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.69■■■■■ 5.55
SERINC2-201ENST00000373709 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.5
SERINC2-201ENST00000373709 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
SERINC2-201ENST00000373709 SMARCA4P51532 1647 aa49.23■■■■■ 5.47
SERINC2-201ENST00000373709 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.23■■■■■ 5.47
SERINC2-201ENST00000373709 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.22■■■■■ 5.47
SERINC2-201ENST00000373709 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.05■■■■■ 5.44
SERINC2-201ENST00000373709 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.04■■■■■ 5.44
SERINC2-201ENST00000373709 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.94■■■■■ 5.43
SERINC2-201ENST00000373709 WIZO95785 1651 aa48.78■■■■■ 5.4
SERINC2-201ENST00000373709 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.72■■■■■ 5.39
SERINC2-201ENST00000373709 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.6■■■■■ 5.37
SERINC2-201ENST00000373709 SMARCA2P51531 1590 aa48.59■■■■■ 5.37
SERINC2-201ENST00000373709 NCAPD3P42695 1498 aa48.43■■■■■ 5.34
SERINC2-201ENST00000373709 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.38■■■■■ 5.33
SERINC2-201ENST00000373709 HMGXB3Q12766 1538 aa48.28■■■■■ 5.32
SERINC2-201ENST00000373709 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
SERINC2-201ENST00000373709 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.01■■■■■ 5.28
SERINC2-201ENST00000373709 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.67■■■■■ 5.22
SERINC2-201ENST00000373709 NESP48681 1621 aa47.3■■■■■ 5.16
SERINC2-201ENST00000373709 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.14■■■■■ 5.14
SERINC2-201ENST00000373709 CFTRP13569 1480 aa47.06■■■■■ 5.12
SERINC2-201ENST00000373709 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47■■■■■ 5.11
SERINC2-201ENST00000373709 PRDM2Q13029 1718 aa46.72■■■■■ 5.07
SERINC2-201ENST00000373709 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.68■■■■■ 5.06
SERINC2-201ENST00000373709 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.67■■■■■ 5.06
SERINC2-201ENST00000373709 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.66■■■■■ 5.06
SERINC2-201ENST00000373709 ERCC6Q03468 1493 aa46.61■■■■■ 5.05
SERINC2-201ENST00000373709 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.48■■■■■ 5.03
SERINC2-201ENST00000373709 ABCC8Q09428 1581 aa46.39■■■■■ 5.02
SERINC2-201ENST00000373709 TRIM41Q8WV44 630 aa46.24■■■■■ 4.99
SERINC2-201ENST00000373709 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
SERINC2-201ENST00000373709 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
SERINC2-201ENST00000373709 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.19■■■■■ 4.98
SERINC2-201ENST00000373709 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.19■■■■■ 4.98
SERINC2-201ENST00000373709 CUX1P39880 1505 aa46.1■■■■■ 4.97
SERINC2-201ENST00000373709 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.09■■■■■ 4.97
SERINC2-201ENST00000373709 SYNJ1O43426 1573 aa46.05■■■■■ 4.96
SERINC2-201ENST00000373709 TOPBP1Q92547 1522 aa46.03■■■■■ 4.96
SERINC2-201ENST00000373709 WDR62O43379 1518 aa46.01■■■■■ 4.96
SERINC2-201ENST00000373709 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.99■■■■■ 4.95
SERINC2-201ENST00000373709 TOP2BQ02880 1626 aa45.85■■■■■ 4.93
SERINC2-201ENST00000373709 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.82■■■■■ 4.92
SERINC2-201ENST00000373709 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.78■■■■■ 4.92
SERINC2-201ENST00000373709 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
SERINC2-201ENST00000373709 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.69■■■■■ 4.91
SERINC2-201ENST00000373709 HRCP23327 699 aa45.68■■■■■ 4.9
SERINC2-201ENST00000373709 CUX2O14529 1486 aa45.65■■■■■ 4.9
SERINC2-201ENST00000373709 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.64■■■■■ 4.9
SERINC2-201ENST00000373709 SOGA1O94964 1423 aa45.52■■■■■ 4.88
SERINC2-201ENST00000373709 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
SERINC2-201ENST00000373709 IFT140Q96RY7 1462 aa45.39■■■■■ 4.86
SERINC2-201ENST00000373709 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
SERINC2-201ENST00000373709 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.85
SERINC2-201ENST00000373709 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
SERINC2-201ENST00000373709 WDR97A6NE52 1622 aa45.29■■■■■ 4.84
SERINC2-201ENST00000373709 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
SERINC2-201ENST00000373709 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.26■■■■■ 4.84
SERINC2-201ENST00000373709 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.21■■■■■ 4.836e-8■■■■■ 38.5
SERINC2-201ENST00000373709 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.17■■■■■ 4.82
SERINC2-201ENST00000373709 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
SERINC2-201ENST00000373709 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.06■■■■■ 4.8
SERINC2-201ENST00000373709 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.01■■■■■ 4.8
SERINC2-201ENST00000373709 KIF27Q86VH2 1401 aa44.98■■■■■ 4.79
SERINC2-201ENST00000373709 EEA1Q15075 1411 aa44.94■■■■■ 4.79
SERINC2-201ENST00000373709 PBRM1Q86U86 1689 aa44.88■■■■■ 4.78
SERINC2-201ENST00000373709 GRIN2BQ13224 1484 aa44.81■■■■■ 4.76
SERINC2-201ENST00000373709 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.76■■■■■ 4.76
SERINC2-201ENST00000373709 IGF1RP08069 1367 aa44.75■■■■■ 4.75
SERINC2-201ENST00000373709 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.7■■■■■ 4.75
SERINC2-201ENST00000373709 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.65■■■■■ 4.74
SERINC2-201ENST00000373709 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.61■■■■■ 4.73
SERINC2-201ENST00000373709 ADAMTS12P58397 1594 aa44.57■■■■■ 4.73
SERINC2-201ENST00000373709 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
SERINC2-201ENST00000373709 FBLN2P98095 1184 aa44.54■■■■■ 4.72
SERINC2-201ENST00000373709 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.53■■■■■ 4.72
SERINC2-201ENST00000373709 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.5■■■■■ 4.71
SERINC2-201ENST00000373709 CUL7Q14999 1698 aa44.48■■■■■ 4.71
SERINC2-201ENST00000373709 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.45■■■■■ 4.71
SERINC2-201ENST00000373709 SYNJ2O15056 1496 aa44.42■■■■■ 4.7
SERINC2-201ENST00000373709 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
SERINC2-201ENST00000373709 PRXQ9BXM0 1461 aa44.4■■■■■ 4.7
SERINC2-201ENST00000373709 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
SERINC2-201ENST00000373709 CHD1O14646 1710 aa44.4■■■■■ 4.7
SERINC2-201ENST00000373709 CEP162Q5TB80 1403 aa44.37■■■■■ 4.69
SERINC2-201ENST00000373709 GOLGA3Q08378 1498 aa44.36■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms