RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.58■■■■■ 8.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.18■■■■■ 6.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.13■■■■■ 6.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.29■■■■■ 6.28
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.01■■■■■ 6.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCC9O60706 1549 aa53.76■■■■■ 6.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.59■■■■■ 6.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.5■■■■■ 6.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 NACADO15069 1562 aa53.19■■■■■ 6.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.68■■■■■ 6.02
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCRIBQ14160 1630 aa52.5■■■■■ 6
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.62■■■■■ 5.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.6■■■■■ 5.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.03■■■■■ 5.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.91■■■■■ 5.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.88■■■■■ 5.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.7■■■■■ 5.71
CTDNEP1-208ENST00000573600 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.66■■■■■ 5.7
CTDNEP1-208ENST00000573600 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.63■■■■■ 5.7
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMARCA4P51532 1647 aa50.38■■■■■ 5.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 WIZO95785 1651 aa50.25■■■■■ 5.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.79■■■■■ 5.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.77■■■■■ 5.56
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.53■■■■■ 5.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMARCA2P51531 1590 aa49.52■■■■■ 5.52
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.5■■■■■ 5.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.48■■■■■ 5.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.22■■■■■ 5.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCAPD3P42695 1498 aa49.06■■■■■ 5.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 HMGXB3Q12766 1538 aa49.04■■■■■ 5.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.71■■■■■ 5.39
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM41Q8WV44 630 aa48.57■■■■■ 5.37
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCC8Q09428 1581 aa48.22■■■■■ 5.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFTRP13569 1480 aa48.01■■■■■ 5.28
CTDNEP1-208ENST00000573600 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.94■■■■■ 5.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRDM2Q13029 1718 aa47.87■■■■■ 5.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.8■■■■■ 5.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYNJ1O43426 1573 aa47.71■■■■■ 5.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.6■■■■■ 5.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.58■■■■■ 5.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOP2BQ02880 1626 aa47.56■■■■■ 5.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.53■■■■■ 5.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.53■■■■■ 5.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 EEA1Q15075 1411 aa47.42■■■■■ 5.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.39■■■■■ 5.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOGA1O94964 1423 aa47.34■■■■■ 5.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 CUX1P39880 1505 aa47.34■■■■■ 5.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.26■■■■■ 5.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 NESP48681 1621 aa47.25■■■■■ 5.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.14■■■■■ 5.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.08■■■■■ 5.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47■■■■■ 5.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.97■■■■■ 5.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.92■■■■■ 5.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.86■■■■■ 5.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.81■■■■■ 5.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOPBP1Q92547 1522 aa46.78■■■■■ 5.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF21BO75037 1637 aa46.78■■■■■ 5.08
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA3Q08378 1498 aa46.74■■■■■ 5.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF27Q86VH2 1401 aa46.74■■■■■ 5.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.62■■■■■ 5.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.55■■■■■ 5.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 CUX2O14529 1486 aa46.53■■■■■ 5.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.44■■■■■ 5.02
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.43■■■■■ 5.02
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.39■■■■■ 5.02
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.37■■■■■ 5.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.37■■■■■ 5.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP162Q5TB80 1403 aa46.35■■■■■ 5.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR97A6NE52 1622 aa46.28■■■■■ 5
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGF1RP08069 1367 aa46.26■■■■■ 5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERCC6Q03468 1493 aa46.13■■■■■ 4.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR62O43379 1518 aa46.12■■■■■ 4.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.05■■■■■ 4.96
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.04■■■■■ 4.96
CTDNEP1-208ENST00000573600 CUL7Q14999 1698 aa45.98■■■■■ 4.95
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLIP1P30622 1438 aa45.96■■■■■ 4.95
CTDNEP1-208ENST00000573600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.92■■■■■ 4.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFT140Q96RY7 1462 aa45.85■■■■■ 4.93
CTDNEP1-208ENST00000573600 PBRM1Q86U86 1689 aa45.68■■■■■ 4.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.62■■■■■ 4.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.6■■■■■ 4.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.58■■■■■ 4.892e-6■■■■■ 28.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRIN2BQ13224 1484 aa45.54■■■■■ 4.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.49■■■■■ 4.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARAP1Q96P48 1450 aa45.47■■■■■ 4.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.44■■■■■ 4.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.44■■■■■ 4.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
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