RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-215ENST00000514153 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.08■■■■■ 8.81
FAM149A-215ENST00000514153 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.23■■■■■ 7.39
FAM149A-215ENST00000514153 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.79■■■■■ 7
FAM149A-215ENST00000514153 ABCC9O60706 1549 aa58.43■■■■■ 6.94
FAM149A-215ENST00000514153 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.22■■■■■ 6.91
FAM149A-215ENST00000514153 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.83■■■■■ 6.85
FAM149A-215ENST00000514153 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.25■■■■■ 6.76
FAM149A-215ENST00000514153 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.13■■■■■ 6.74
FAM149A-215ENST00000514153 NACADO15069 1562 aa57.12■■■■■ 6.73
FAM149A-215ENST00000514153 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.76■■■■■ 6.68
FAM149A-215ENST00000514153 SCRIBQ14160 1630 aa56.44■■■■■ 6.63
FAM149A-215ENST00000514153 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.7■■■■■ 6.51
FAM149A-215ENST00000514153 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.1■■■■■ 6.41
FAM149A-215ENST00000514153 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.07■■■■■ 6.41
FAM149A-215ENST00000514153 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.74■■■■■ 6.35
FAM149A-215ENST00000514153 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.59■■■■■ 6.33
FAM149A-215ENST00000514153 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.25■■■■■ 6.28
FAM149A-215ENST00000514153 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.2■■■■■ 6.27
FAM149A-215ENST00000514153 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.13■■■■■ 6.26
FAM149A-215ENST00000514153 SMARCA4P51532 1647 aa53.98■■■■■ 6.23
FAM149A-215ENST00000514153 WIZO95785 1651 aa53.77■■■■■ 6.2
FAM149A-215ENST00000514153 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.48■■■■■ 6.15
FAM149A-215ENST00000514153 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.25■■■■■ 6.11
FAM149A-215ENST00000514153 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.18■■■■■ 6.1
FAM149A-215ENST00000514153 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.1■■■■■ 6.09
FAM149A-215ENST00000514153 SMARCA2P51531 1590 aa53.09■■■■■ 6.09
FAM149A-215ENST00000514153 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
FAM149A-215ENST00000514153 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.82■■■■■ 6.05
FAM149A-215ENST00000514153 NCAPD3P42695 1498 aa52.73■■■■■ 6.03
FAM149A-215ENST00000514153 HMGXB3Q12766 1538 aa52.63■■■■■ 6.02
FAM149A-215ENST00000514153 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.6■■■■■ 6.01
FAM149A-215ENST00000514153 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.09■■■■■ 5.93
FAM149A-215ENST00000514153 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.9■■■■■ 5.9
FAM149A-215ENST00000514153 CFTRP13569 1480 aa51.48■■■■■ 5.83
FAM149A-215ENST00000514153 ABCC8Q09428 1581 aa51.46■■■■■ 5.83
FAM149A-215ENST00000514153 TRIM41Q8WV44 630 aa51.41■■■■■ 5.82
FAM149A-215ENST00000514153 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.39■■■■■ 5.82
FAM149A-215ENST00000514153 PRDM2Q13029 1718 aa51.2■■■■■ 5.79
FAM149A-215ENST00000514153 NESP48681 1621 aa51.2■■■■■ 5.79
FAM149A-215ENST00000514153 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.08■■■■■ 5.77
FAM149A-215ENST00000514153 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.02■■■■■ 5.76
FAM149A-215ENST00000514153 SYNJ1O43426 1573 aa50.94■■■■■ 5.74
FAM149A-215ENST00000514153 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.87■■■■■ 5.73
FAM149A-215ENST00000514153 CUX1P39880 1505 aa50.69■■■■■ 5.71
FAM149A-215ENST00000514153 TOP2BQ02880 1626 aa50.68■■■■■ 5.7
FAM149A-215ENST00000514153 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.64■■■■■ 5.7
FAM149A-215ENST00000514153 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.63■■■■■ 5.7
FAM149A-215ENST00000514153 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.59■■■■■ 5.69
FAM149A-215ENST00000514153 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.58■■■■■ 5.69
FAM149A-215ENST00000514153 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.54■■■■■ 5.68
FAM149A-215ENST00000514153 SOGA1O94964 1423 aa50.39■■■■■ 5.66
FAM149A-215ENST00000514153 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.3■■■■■ 5.64
FAM149A-215ENST00000514153 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
FAM149A-215ENST00000514153 TOPBP1Q92547 1522 aa50.27■■■■■ 5.64
FAM149A-215ENST00000514153 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.25■■■■■ 5.63
FAM149A-215ENST00000514153 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.2■■■■■ 5.63
FAM149A-215ENST00000514153 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.2■■■■■ 5.63
FAM149A-215ENST00000514153 ERCC6Q03468 1493 aa50.11■■■■■ 5.61
FAM149A-215ENST00000514153 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.04■■■■■ 5.6
FAM149A-215ENST00000514153 EEA1Q15075 1411 aa50.03■■■■■ 5.6
FAM149A-215ENST00000514153 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.01■■■■■ 5.6
FAM149A-215ENST00000514153 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.01■■■■■ 5.6
FAM149A-215ENST00000514153 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.91■■■■■ 5.58
FAM149A-215ENST00000514153 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.9■■■■■ 5.58
FAM149A-215ENST00000514153 CUX2O14529 1486 aa49.82■■■■■ 5.57
FAM149A-215ENST00000514153 KIF27Q86VH2 1401 aa49.79■■■■■ 5.56
FAM149A-215ENST00000514153 WDR62O43379 1518 aa49.78■■■■■ 5.56
FAM149A-215ENST00000514153 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.76■■■■■ 5.56
FAM149A-215ENST00000514153 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.68■■■■■ 5.54
FAM149A-215ENST00000514153 WDR97A6NE52 1622 aa49.59■■■■■ 5.53
FAM149A-215ENST00000514153 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.54■■■■■ 5.52
FAM149A-215ENST00000514153 KIF21BO75037 1637 aa49.47■■■■■ 5.51
FAM149A-215ENST00000514153 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.45■■■■■ 5.51
FAM149A-215ENST00000514153 GOLGA3Q08378 1498 aa49.42■■■■■ 5.5
FAM149A-215ENST00000514153 IGF1RP08069 1367 aa49.41■■■■■ 5.5
FAM149A-215ENST00000514153 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.37■■■■■ 5.49
FAM149A-215ENST00000514153 PRXQ9BXM0 1461 aa49.35■■■■■ 5.49
FAM149A-215ENST00000514153 IFT140Q96RY7 1462 aa49.34■■■■■ 5.49
FAM149A-215ENST00000514153 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.34■■■■■ 5.49
FAM149A-215ENST00000514153 UBTFP17480 764 aaKnown RBP49.32■■■■■ 5.49
FAM149A-215ENST00000514153 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.27■■■■■ 5.48
FAM149A-215ENST00000514153 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.2■■■■■ 5.47
FAM149A-215ENST00000514153 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.19■■■■■ 5.47
FAM149A-215ENST00000514153 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.19■■■■■ 5.46
FAM149A-215ENST00000514153 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.17■■■■■ 5.46
FAM149A-215ENST00000514153 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.16■■■■■ 5.46
FAM149A-215ENST00000514153 PBRM1Q86U86 1689 aa49.05■■■■■ 5.44
FAM149A-215ENST00000514153 CUL7Q14999 1698 aa49.03■■■■■ 5.44
FAM149A-215ENST00000514153 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49■■■■■ 5.43
FAM149A-215ENST00000514153 CEP162Q5TB80 1403 aa48.95■■■■■ 5.43
FAM149A-215ENST00000514153 GRIN2BQ13224 1484 aa48.92■■■■■ 5.42
FAM149A-215ENST00000514153 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
FAM149A-215ENST00000514153 ADAMTS12P58397 1594 aa48.74■■■■■ 5.39
FAM149A-215ENST00000514153 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.71■■■■■ 5.39
FAM149A-215ENST00000514153 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.7■■■■■ 5.39
FAM149A-215ENST00000514153 CLIP1P30622 1438 aa48.66■■■■■ 5.38
FAM149A-215ENST00000514153 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.53■■■■■ 5.36
FAM149A-215ENST00000514153 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.48■■■■■ 5.35
FAM149A-215ENST00000514153 SYNJ2O15056 1496 aa48.37■■■■■ 5.33
FAM149A-215ENST00000514153 GRIN2AQ12879 1464 aa48.35■■■■■ 5.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms