RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611394.4

PRR5-216, Transcript of proline rich 5, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRR5, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-216ENST00000611394 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.34■■■■■ 9.49
PRR5-216ENST00000611394 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa65.19■■■■■ 8.03
PRR5-216ENST00000611394 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.34■■■■■ 7.57
PRR5-216ENST00000611394 ABCC9O60706 1549 aa62.05■■■■■ 7.52
PRR5-216ENST00000611394 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61.52■■■■■ 7.44
PRR5-216ENST00000611394 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa61.51■■■■■ 7.44
PRR5-216ENST00000611394 MYO15BQ96JP2 1530 aa61.01■■■■■ 7.36
PRR5-216ENST00000611394 NACADO15069 1562 aa60.81■■■■■ 7.33
PRR5-216ENST00000611394 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.45■■■■■ 7.27
PRR5-216ENST00000611394 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.15■■■■■ 7.22
PRR5-216ENST00000611394 SCRIBQ14160 1630 aa59.79■■■■■ 7.16
PRR5-216ENST00000611394 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.19■■■■■ 7.07
PRR5-216ENST00000611394 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.56■■■■■ 6.97
PRR5-216ENST00000611394 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.34■■■■■ 6.93
PRR5-216ENST00000611394 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.75■■■■■ 6.84
PRR5-216ENST00000611394 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP57.6■■■■■ 6.81
PRR5-216ENST00000611394 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP57.49■■■■■ 6.79
PRR5-216ENST00000611394 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.41■■■■■ 6.78
PRR5-216ENST00000611394 MROH2BQ7Z745 1585 aa57.38■■■■■ 6.78
PRR5-216ENST00000611394 SMARCA4P51532 1647 aa57.3■■■■■ 6.76
PRR5-216ENST00000611394 WIZO95785 1651 aa56.91■■■■■ 6.7
PRR5-216ENST00000611394 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.87■■■■■ 6.69
PRR5-216ENST00000611394 PEG3Q9GZU2 1588 aa56.62■■■■■ 6.66
PRR5-216ENST00000611394 SMARCA2P51531 1590 aa56.48■■■■■ 6.63
PRR5-216ENST00000611394 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.46■■■■■ 6.63
PRR5-216ENST00000611394 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56.34■■■■■ 6.61
PRR5-216ENST00000611394 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.18■■■■■ 6.58
PRR5-216ENST00000611394 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP56.15■■■■■ 6.58
PRR5-216ENST00000611394 NCAPD3P42695 1498 aa56.08■■■■■ 6.57
PRR5-216ENST00000611394 HMGXB3Q12766 1538 aa56.01■■■■■ 6.56
PRR5-216ENST00000611394 CCDC88BA6NC98 1476 aa55.7■■■■■ 6.51
PRR5-216ENST00000611394 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.14■■■■■ 6.42
PRR5-216ENST00000611394 CHIC1Q5VXU3 224 aa54.84■■■■■ 6.37
PRR5-216ENST00000611394 CFTRP13569 1480 aa54.68■■■■■ 6.34
PRR5-216ENST00000611394 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.6■■■■■ 6.33
PRR5-216ENST00000611394 PRDM2Q13029 1718 aa54.48■■■■■ 6.31
PRR5-216ENST00000611394 ABCC8Q09428 1581 aa54.34■■■■■ 6.29
PRR5-216ENST00000611394 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.33■■■■■ 6.29
PRR5-216ENST00000611394 NESP48681 1621 aa54.27■■■■■ 6.28
PRR5-216ENST00000611394 TRIM41Q8WV44 630 aa54.24■■■■■ 6.27
PRR5-216ENST00000611394 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.1■■■■■ 6.255e-6■■■■■ 46
PRR5-216ENST00000611394 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.01■■■■■ 6.24
PRR5-216ENST00000611394 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.9■■■■■ 6.22
PRR5-216ENST00000611394 SYNJ1O43426 1573 aa53.88■■■■■ 6.22
PRR5-216ENST00000611394 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.76■■■■■ 6.2
PRR5-216ENST00000611394 TOP2BQ02880 1626 aa53.75■■■■■ 6.19
PRR5-216ENST00000611394 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.72■■■■■ 6.19
PRR5-216ENST00000611394 CUX1P39880 1505 aa53.71■■■■■ 6.19
PRR5-216ENST00000611394 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.7■■■■■ 6.19
PRR5-216ENST00000611394 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53.46■■■■■ 6.15
PRR5-216ENST00000611394 TOPBP1Q92547 1522 aa53.36■■■■■ 6.13
PRR5-216ENST00000611394 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.35■■■■■ 6.13
PRR5-216ENST00000611394 ERCC6Q03468 1493 aa53.31■■■■■ 6.12
PRR5-216ENST00000611394 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.25■■■■■ 6.11
PRR5-216ENST00000611394 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.23■■■■■ 6.11
PRR5-216ENST00000611394 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP53.18■■■■■ 6.1
PRR5-216ENST00000611394 SOGA1O94964 1423 aa53.18■■■■■ 6.1
PRR5-216ENST00000611394 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53.05■■■■■ 6.08
PRR5-216ENST00000611394 EEA1Q15075 1411 aa53.05■■■■■ 6.08
PRR5-216ENST00000611394 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52.99■■■■■ 6.07
PRR5-216ENST00000611394 WDR62O43379 1518 aa52.98■■■■■ 6.07
PRR5-216ENST00000611394 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.96■■■■■ 6.07
PRR5-216ENST00000611394 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.84■■■■■ 6.05
PRR5-216ENST00000611394 KIF27Q86VH2 1401 aa52.8■■■■■ 6.04
PRR5-216ENST00000611394 CUX2O14529 1486 aa52.77■■■■■ 6.04
PRR5-216ENST00000611394 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa52.76■■■■■ 6.04
PRR5-216ENST00000611394 CSRNP3Q8WYN3 585 aa52.75■■■■■ 6.04
PRR5-216ENST00000611394 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa52.67■■■■■ 6.02
PRR5-216ENST00000611394 WDR97A6NE52 1622 aa52.67■■■■■ 6.02
PRR5-216ENST00000611394 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.62■■■■■ 6.01
PRR5-216ENST00000611394 IFT140Q96RY7 1462 aa52.5■■■■■ 6
PRR5-216ENST00000611394 EHMT2Q96KQ7 1210 aa52.43■■■■■ 5.98
PRR5-216ENST00000611394 KIF21BO75037 1637 aa52.39■■■■■ 5.98
PRR5-216ENST00000611394 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.39■■■■■ 5.98
PRR5-216ENST00000611394 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.38■■■■■ 5.98
PRR5-216ENST00000611394 IGF1RP08069 1367 aa52.33■■■■■ 5.97
PRR5-216ENST00000611394 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.3■■■■■ 5.96
PRR5-216ENST00000611394 GOLGA3Q08378 1498 aa52.27■■■■■ 5.96
PRR5-216ENST00000611394 PRXQ9BXM0 1461 aa52.26■■■■■ 5.96
PRR5-216ENST00000611394 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.17■■■■■ 5.94
PRR5-216ENST00000611394 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.15■■■■■ 5.94
PRR5-216ENST00000611394 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.15■■■■■ 5.941e-6■■■■□ 21.9
PRR5-216ENST00000611394 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa52.14■■■■■ 5.94
PRR5-216ENST00000611394 PBRM1Q86U86 1689 aa52.09■■■■■ 5.93
PRR5-216ENST00000611394 CUL7Q14999 1698 aa52.09■■■■■ 5.93
PRR5-216ENST00000611394 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52.08■■■■■ 5.93
PRR5-216ENST00000611394 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.05■■■■■ 5.92
PRR5-216ENST00000611394 UBTFP17480 764 aaKnown RBP52.04■■■■■ 5.92
PRR5-216ENST00000611394 GRIN2BQ13224 1484 aa51.99■■■■■ 5.91
PRR5-216ENST00000611394 TNIKQ9UKE5 1360 aa51.97■■■■■ 5.91
PRR5-216ENST00000611394 ADAMTS12P58397 1594 aa51.75■■■■■ 5.88
PRR5-216ENST00000611394 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.73■■■■■ 5.87
PRR5-216ENST00000611394 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.69■■■■■ 5.87
PRR5-216ENST00000611394 CEP162Q5TB80 1403 aa51.64■■■■■ 5.86
PRR5-216ENST00000611394 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.63■■■■■ 5.86
PRR5-216ENST00000611394 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.44■■■■■ 5.82
PRR5-216ENST00000611394 SYNJ2O15056 1496 aa51.42■■■■■ 5.82
PRR5-216ENST00000611394 CLIP1P30622 1438 aa51.4■■■■■ 5.82
PRR5-216ENST00000611394 GRIN2AQ12879 1464 aa51.34■■■■■ 5.81
PRR5-216ENST00000611394 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP51.31■■■■■ 5.81
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