RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221138.8

PPP2CB-201, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP2CB, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-201ENST00000221138 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.74■■■■■ 8.11
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.76■■■■■ 6.84
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCC9O60706 1549 aa55.28■■■■■ 6.44
PPP2CB-201ENST00000221138 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.05■■■■■ 6.4
PPP2CB-201ENST00000221138 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.54■■■■■ 6.32
PPP2CB-201ENST00000221138 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.36■■■■■ 6.29
PPP2CB-201ENST00000221138 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.02■■■■■ 6.24
PPP2CB-201ENST00000221138 NACADO15069 1562 aa53.96■■■■■ 6.23
PPP2CB-201ENST00000221138 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.92■■■■■ 6.22
PPP2CB-201ENST00000221138 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.69■■■■■ 6.18
PPP2CB-201ENST00000221138 SCRIBQ14160 1630 aa52.96■■■■■ 6.07
PPP2CB-201ENST00000221138 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
PPP2CB-201ENST00000221138 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.67■■■■■ 6.02
PPP2CB-201ENST00000221138 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.09■■■■■ 5.93
PPP2CB-201ENST00000221138 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.96■■■■■ 5.91
PPP2CB-201ENST00000221138 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.75■■■■■ 5.87
PPP2CB-201ENST00000221138 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.14■■■■■ 5.78
PPP2CB-201ENST00000221138 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.83■■■■■ 5.73
PPP2CB-201ENST00000221138 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.76■■■■■ 5.72
PPP2CB-201ENST00000221138 SMARCA4P51532 1647 aa50.73■■■■■ 5.71
PPP2CB-201ENST00000221138 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.67■■■■■ 5.7
PPP2CB-201ENST00000221138 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.57■■■■■ 5.69
PPP2CB-201ENST00000221138 WIZO95785 1651 aa50.34■■■■■ 5.65
PPP2CB-201ENST00000221138 HRCP23327 699 aa50.19■■■■■ 5.62
PPP2CB-201ENST00000221138 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.14■■■■■ 5.62
PPP2CB-201ENST00000221138 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.07■■■■■ 5.61
PPP2CB-201ENST00000221138 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.05■■■■■ 5.6
PPP2CB-201ENST00000221138 SMARCA2P51531 1590 aa50.04■■■■■ 5.6
PPP2CB-201ENST00000221138 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.89■■■■■ 5.58
PPP2CB-201ENST00000221138 PCGF6Q9BYE7 350 aa49.86■■■■■ 5.57
PPP2CB-201ENST00000221138 NCAPD3P42695 1498 aa49.78■■■■■ 5.56
PPP2CB-201ENST00000221138 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.76■■■■■ 5.56
PPP2CB-201ENST00000221138 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.75■■■■■ 5.55
PPP2CB-201ENST00000221138 HMGXB3Q12766 1538 aa49.65■■■■■ 5.54
PPP2CB-201ENST00000221138 TRIM41Q8WV44 630 aa49.51■■■■■ 5.52
PPP2CB-201ENST00000221138 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.5■■■■■ 5.51
PPP2CB-201ENST00000221138 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP49.26■■■■■ 5.48
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.24■■■■■ 5.47
PPP2CB-201ENST00000221138 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.74■■■■■ 5.39
PPP2CB-201ENST00000221138 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.7■■■■■ 5.39
PPP2CB-201ENST00000221138 CFTRP13569 1480 aa48.45■■■■■ 5.35
PPP2CB-201ENST00000221138 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.44■■■■■ 5.35
PPP2CB-201ENST00000221138 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP48.37■■■■■ 5.33
PPP2CB-201ENST00000221138 NESP48681 1621 aa48.29■■■■■ 5.32
PPP2CB-201ENST00000221138 PRDM2Q13029 1718 aa48.26■■■■■ 5.32
PPP2CB-201ENST00000221138 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.24■■■■■ 5.31
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCC8Q09428 1581 aa48.22■■■■■ 5.31
PPP2CB-201ENST00000221138 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.01■■■■■ 5.28
PPP2CB-201ENST00000221138 EEA1Q15075 1411 aa47.95■■■■■ 5.27
PPP2CB-201ENST00000221138 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.91■■■■■ 5.26
PPP2CB-201ENST00000221138 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.87■■■■■ 5.25
PPP2CB-201ENST00000221138 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.85■■■■■ 5.25
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.76■■■■■ 5.24
PPP2CB-201ENST00000221138 SOGA1O94964 1423 aa47.71■■■■■ 5.23
PPP2CB-201ENST00000221138 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.69■■■■■ 5.23
PPP2CB-201ENST00000221138 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.68■■■■■ 5.22
PPP2CB-201ENST00000221138 CEP162Q5TB80 1403 aa47.63■■■■■ 5.22
PPP2CB-201ENST00000221138 SYNJ1O43426 1573 aa47.58■■■■■ 5.21
PPP2CB-201ENST00000221138 CUX1P39880 1505 aa47.52■■■■■ 5.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.49■■■■■ 5.19
PPP2CB-201ENST00000221138 ERCC6Q03468 1493 aa47.48■■■■■ 5.19
PPP2CB-201ENST00000221138 TOP2BQ02880 1626 aa47.46■■■■■ 5.19
PPP2CB-201ENST00000221138 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.44■■■■■ 5.18
PPP2CB-201ENST00000221138 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.44■■■■■ 5.18
PPP2CB-201ENST00000221138 GOLGA3Q08378 1498 aa47.44■■■■■ 5.18
PPP2CB-201ENST00000221138 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
PPP2CB-201ENST00000221138 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.35■■■■■ 5.17
PPP2CB-201ENST00000221138 TOPBP1Q92547 1522 aa47.31■■■■■ 5.16
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF21BO75037 1637 aa47.31■■■■■ 5.16
PPP2CB-201ENST00000221138 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.3■■■■■ 5.16
PPP2CB-201ENST00000221138 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
PPP2CB-201ENST00000221138 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.12■■■■■ 5.13
PPP2CB-201ENST00000221138 WDR62O43379 1518 aa47.1■■■■■ 5.13
PPP2CB-201ENST00000221138 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
PPP2CB-201ENST00000221138 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.01■■■■■ 5.12
PPP2CB-201ENST00000221138 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.96■■■■■ 5.11
PPP2CB-201ENST00000221138 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP46.96■■■■■ 5.11
PPP2CB-201ENST00000221138 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.85■■■■■ 5.09
PPP2CB-201ENST00000221138 CUX2O14529 1486 aa46.76■■■■■ 5.08
PPP2CB-201ENST00000221138 CLIP1P30622 1438 aa46.75■■■■■ 5.07
PPP2CB-201ENST00000221138 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.68■■■■■ 5.06
PPP2CB-201ENST00000221138 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.66■■■■■ 5.06
PPP2CB-201ENST00000221138 WDR97A6NE52 1622 aa46.66■■■■■ 5.06
PPP2CB-201ENST00000221138 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.65■■■■■ 5.06
PPP2CB-201ENST00000221138 IFT140Q96RY7 1462 aa46.59■■■■■ 5.05
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF27Q86VH2 1401 aa46.59■■■■■ 5.05
PPP2CB-201ENST00000221138 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.57■■■■■ 5.05
PPP2CB-201ENST00000221138 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
PPP2CB-201ENST00000221138 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.46■■■■■ 5.03
PPP2CB-201ENST00000221138 PRXQ9BXM0 1461 aa46.41■■■■■ 5.02
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.4■■■■■ 5.02
PPP2CB-201ENST00000221138 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.01
PPP2CB-201ENST00000221138 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.33■■■■■ 5.01
PPP2CB-201ENST00000221138 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.31■■■■■ 57e-9■■■□□ 14.9
PPP2CB-201ENST00000221138 IGF1RP08069 1367 aa46.26■■■■■ 5
PPP2CB-201ENST00000221138 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
PPP2CB-201ENST00000221138 PBRM1Q86U86 1689 aa46.18■■■■■ 4.98
PPP2CB-201ENST00000221138 APLP2Q06481 763 aa46.13■■■■■ 4.98
PPP2CB-201ENST00000221138 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
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