RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313285.12

TRIP10-202, Transcript of thyroid hormone receptor interactor 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIP10, Length 2,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10-202ENST00000313285 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.58■■■■■ 8.41
TRIP10-202ENST00000313285 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.52■■■■■ 6.96
TRIP10-202ENST00000313285 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.9■■■■■ 6.7
TRIP10-202ENST00000313285 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.86■■■■■ 6.53
TRIP10-202ENST00000313285 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.65■■■■■ 6.5
TRIP10-202ENST00000313285 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.62■■■■■ 6.49
TRIP10-202ENST00000313285 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.95■■■■■ 6.39
TRIP10-202ENST00000313285 ABCC9O60706 1549 aa54.84■■■■■ 6.37
TRIP10-202ENST00000313285 NACADO15069 1562 aa54.4■■■■■ 6.3
TRIP10-202ENST00000313285 SCRIBQ14160 1630 aa53.97■■■■■ 6.23
TRIP10-202ENST00000313285 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.87■■■■■ 6.21
TRIP10-202ENST00000313285 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.76■■■■■ 6.2
TRIP10-202ENST00000313285 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.72■■■■■ 6.03
TRIP10-202ENST00000313285 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.69■■■■■ 6.02
TRIP10-202ENST00000313285 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.49■■■■■ 5.99
TRIP10-202ENST00000313285 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.24■■■■■ 5.95
TRIP10-202ENST00000313285 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.18■■■■■ 5.94
TRIP10-202ENST00000313285 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.11■■■■■ 5.93
TRIP10-202ENST00000313285 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.94■■■■■ 5.9
TRIP10-202ENST00000313285 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.91■■■■■ 5.93e-7■□□□□ 8
TRIP10-202ENST00000313285 WIZO95785 1651 aa51.83■■■■■ 5.89
TRIP10-202ENST00000313285 SMARCA4P51532 1647 aa51.77■■■■■ 5.88
TRIP10-202ENST00000313285 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.29■■■■■ 5.8
TRIP10-202ENST00000313285 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.14■■■■■ 5.78
TRIP10-202ENST00000313285 SMARCA2P51531 1590 aa50.85■■■■■ 5.73
TRIP10-202ENST00000313285 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.83■■■■■ 5.73
TRIP10-202ENST00000313285 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.81■■■■■ 5.72
TRIP10-202ENST00000313285 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.69■■■■■ 5.71
TRIP10-202ENST00000313285 TRIM41Q8WV44 630 aa50.6■■■■■ 5.69
TRIP10-202ENST00000313285 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.53■■■■■ 5.68
TRIP10-202ENST00000313285 NCAPD3P42695 1498 aa50.26■■■■■ 5.64
TRIP10-202ENST00000313285 HMGXB3Q12766 1538 aa50.2■■■■■ 5.63
TRIP10-202ENST00000313285 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.99■■■■■ 5.59
TRIP10-202ENST00000313285 ABCC8Q09428 1581 aa49.96■■■■■ 5.59
TRIP10-202ENST00000313285 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.69■■■■■ 5.55
TRIP10-202ENST00000313285 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.62■■■■■ 5.53
TRIP10-202ENST00000313285 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.58■■■■■ 5.53
TRIP10-202ENST00000313285 CFTRP13569 1480 aa49.34■■■■■ 5.49
TRIP10-202ENST00000313285 SYNJ1O43426 1573 aa49.32■■■■■ 5.49
TRIP10-202ENST00000313285 SOGA1O94964 1423 aa49.2■■■■■ 5.47
TRIP10-202ENST00000313285 EEA1Q15075 1411 aa49.2■■■■■ 5.47
TRIP10-202ENST00000313285 TOP2BQ02880 1626 aa49.07■■■■■ 5.45
TRIP10-202ENST00000313285 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.03■■■■■ 5.44
TRIP10-202ENST00000313285 PRDM2Q13029 1718 aa48.99■■■■■ 5.43
TRIP10-202ENST00000313285 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.98■■■■■ 5.43
TRIP10-202ENST00000313285 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.97■■■■■ 5.43
TRIP10-202ENST00000313285 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.97■■■■■ 5.43
TRIP10-202ENST00000313285 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.92■■■■■ 5.42
TRIP10-202ENST00000313285 CUX1P39880 1505 aa48.79■■■■■ 5.4
TRIP10-202ENST00000313285 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.56■■■■■ 5.36
TRIP10-202ENST00000313285 GOLGA3Q08378 1498 aa48.55■■■■■ 5.36
TRIP10-202ENST00000313285 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.5■■■■■ 5.35
TRIP10-202ENST00000313285 KIF21BO75037 1637 aa48.5■■■■■ 5.35
TRIP10-202ENST00000313285 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.47■■■■■ 5.35
TRIP10-202ENST00000313285 PCGF6Q9BYE7 350 aa48.39■■■■■ 5.34
TRIP10-202ENST00000313285 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.39■■■■■ 5.34
TRIP10-202ENST00000313285 NESP48681 1621 aa48.37■■■■■ 5.33
TRIP10-202ENST00000313285 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
TRIP10-202ENST00000313285 CEP162Q5TB80 1403 aa48.34■■■■■ 5.33
TRIP10-202ENST00000313285 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.29■■■■■ 5.32
TRIP10-202ENST00000313285 KIF27Q86VH2 1401 aa48.26■■■■■ 5.32
TRIP10-202ENST00000313285 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP48.21■■■■■ 5.31
TRIP10-202ENST00000313285 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.16■■■■■ 5.3
TRIP10-202ENST00000313285 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.16■■■■■ 5.3
TRIP10-202ENST00000313285 PRXQ9BXM0 1461 aa48.13■■■■■ 5.3
TRIP10-202ENST00000313285 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.12■■■■■ 5.29
TRIP10-202ENST00000313285 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.07■■■■■ 5.29
TRIP10-202ENST00000313285 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.03■■■■■ 5.28
TRIP10-202ENST00000313285 TOPBP1Q92547 1522 aa48.01■■■■■ 5.28
TRIP10-202ENST00000313285 CUX2O14529 1486 aa47.98■■■■■ 5.27
TRIP10-202ENST00000313285 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
TRIP10-202ENST00000313285 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
TRIP10-202ENST00000313285 CLIP1P30622 1438 aa47.82■■■■■ 5.25
TRIP10-202ENST00000313285 IGF1RP08069 1367 aa47.81■■■■■ 5.24
TRIP10-202ENST00000313285 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.76■■■■■ 5.24
TRIP10-202ENST00000313285 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.72■■■■■ 5.23
TRIP10-202ENST00000313285 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.7■■■■■ 5.23
TRIP10-202ENST00000313285 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.56■■■■■ 5.2
TRIP10-202ENST00000313285 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
TRIP10-202ENST00000313285 HRCP23327 699 aa47.53■■■■■ 5.2
TRIP10-202ENST00000313285 VPS8Q8N3P4 1428 aa47.5■■■■■ 5.19
TRIP10-202ENST00000313285 WDR97A6NE52 1622 aa47.48■■■■■ 5.19
TRIP10-202ENST00000313285 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.35■■■■■ 5.17
TRIP10-202ENST00000313285 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.35■■■■■ 5.17
TRIP10-202ENST00000313285 CUL7Q14999 1698 aa47.28■■■■■ 5.16
TRIP10-202ENST00000313285 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.28■■■■■ 5.16
TRIP10-202ENST00000313285 ARAP1Q96P48 1450 aa47.26■■■■■ 5.16
TRIP10-202ENST00000313285 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.23■■■■■ 5.15
TRIP10-202ENST00000313285 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
TRIP10-202ENST00000313285 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.18■■■■■ 5.14
TRIP10-202ENST00000313285 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.14■■■■■ 5.14
TRIP10-202ENST00000313285 WDR62O43379 1518 aa47.08■■■■■ 5.13
TRIP10-202ENST00000313285 APLP2Q06481 763 aa47.03■■■■■ 5.12
TRIP10-202ENST00000313285 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.03■■■■■ 5.12
TRIP10-202ENST00000313285 ERCC6Q03468 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
TRIP10-202ENST00000313285 IFT140Q96RY7 1462 aa46.89■■■■■ 5.1
TRIP10-202ENST00000313285 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.82■■■■■ 5.09
TRIP10-202ENST00000313285 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.78■■■■■ 5.084e-7■■■■□ 21.9
TRIP10-202ENST00000313285 PBRM1Q86U86 1689 aa46.78■■■■■ 5.08
TRIP10-202ENST00000313285 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 219.3 ms