RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530374.5

CYHR1-209, Transcript of cysteine and histidine rich 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CYHR1, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1-209ENST00000530374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.81■■■■■ 8.77
CYHR1-209ENST00000530374 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.74■■■■■ 7.31
CYHR1-209ENST00000530374 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.69■■■■■ 6.99
CYHR1-209ENST00000530374 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.69■■■■■ 6.83
CYHR1-209ENST00000530374 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.62■■■■■ 6.82
CYHR1-209ENST00000530374 ABCC9O60706 1549 aa57.32■■■■■ 6.77
CYHR1-209ENST00000530374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.15■■■■■ 6.74
CYHR1-209ENST00000530374 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.93■■■■■ 6.7
CYHR1-209ENST00000530374 NACADO15069 1562 aa56.53■■■■■ 6.64
CYHR1-209ENST00000530374 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56■■■■■ 6.56
CYHR1-209ENST00000530374 SCRIBQ14160 1630 aa55.95■■■■■ 6.55
CYHR1-209ENST00000530374 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.08■■■■■ 6.41
CYHR1-209ENST00000530374 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.92■■■■■ 6.38
CYHR1-209ENST00000530374 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.37■■■■■ 6.29
CYHR1-209ENST00000530374 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.28■■■■■ 6.28
CYHR1-209ENST00000530374 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.26■■■■■ 6.28
CYHR1-209ENST00000530374 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.11■■■■■ 6.25
CYHR1-209ENST00000530374 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.97■■■■■ 6.23
CYHR1-209ENST00000530374 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.88■■■■■ 6.22
CYHR1-209ENST00000530374 SMARCA4P51532 1647 aa53.63■■■■■ 6.18
CYHR1-209ENST00000530374 WIZO95785 1651 aa53.54■■■■■ 6.16
CYHR1-209ENST00000530374 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.96■■■■■ 6.07
CYHR1-209ENST00000530374 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.95■■■■■ 6.07
CYHR1-209ENST00000530374 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.9■■■■■ 6.06
CYHR1-209ENST00000530374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.7■■■■■ 6.03
CYHR1-209ENST00000530374 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.69■■■■■ 6.03
CYHR1-209ENST00000530374 SMARCA2P51531 1590 aa52.64■■■■■ 6.02
CYHR1-209ENST00000530374 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.46■■■■■ 5.99
CYHR1-209ENST00000530374 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.41■■■■■ 5.98
CYHR1-209ENST00000530374 NCAPD3P42695 1498 aa52.2■■■■■ 5.95
CYHR1-209ENST00000530374 HMGXB3Q12766 1538 aa52.13■■■■■ 5.94
CYHR1-209ENST00000530374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.86■■■■■ 5.89
CYHR1-209ENST00000530374 TRIM41Q8WV44 630 aa51.75■■■■■ 5.87
CYHR1-209ENST00000530374 ABCC8Q09428 1581 aa51.44■■■■■ 5.83
CYHR1-209ENST00000530374 CFTRP13569 1480 aa51.11■■■■■ 5.77
CYHR1-209ENST00000530374 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.05■■■■■ 5.763e-6■■■■□ 26.3
CYHR1-209ENST00000530374 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.89■■■■■ 5.74
CYHR1-209ENST00000530374 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.89■■■■■ 5.74
CYHR1-209ENST00000530374 SYNJ1O43426 1573 aa50.85■■■■■ 5.73
CYHR1-209ENST00000530374 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.84■■■■■ 5.73
CYHR1-209ENST00000530374 PRDM2Q13029 1718 aa50.81■■■■■ 5.72
CYHR1-209ENST00000530374 TOP2BQ02880 1626 aa50.61■■■■■ 5.69
CYHR1-209ENST00000530374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.56■■■■■ 5.69
CYHR1-209ENST00000530374 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.55■■■■■ 5.68
CYHR1-209ENST00000530374 SOGA1O94964 1423 aa50.52■■■■■ 5.68
CYHR1-209ENST00000530374 CUX1P39880 1505 aa50.45■■■■■ 5.67
CYHR1-209ENST00000530374 NESP48681 1621 aa50.41■■■■■ 5.66
CYHR1-209ENST00000530374 EEA1Q15075 1411 aa50.4■■■■■ 5.66
CYHR1-209ENST00000530374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.38■■■■■ 5.66
CYHR1-209ENST00000530374 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.33■■■■■ 5.65
CYHR1-209ENST00000530374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.33■■■■■ 5.65
CYHR1-209ENST00000530374 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.14■■■■■ 5.62
CYHR1-209ENST00000530374 CSRNP3Q8WYN3 585 aa50.14■■■■■ 5.62
CYHR1-209ENST00000530374 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.98■■■■■ 5.59
CYHR1-209ENST00000530374 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.97■■■■■ 5.59
CYHR1-209ENST00000530374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.9■■■■■ 5.58
CYHR1-209ENST00000530374 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.86■■■■■ 5.57
CYHR1-209ENST00000530374 TOPBP1Q92547 1522 aa49.81■■■■■ 5.56
CYHR1-209ENST00000530374 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.77■■■■■ 5.56
CYHR1-209ENST00000530374 KIF21BO75037 1637 aa49.75■■■■■ 5.56
CYHR1-209ENST00000530374 GOLGA3Q08378 1498 aa49.74■■■■■ 5.55
CYHR1-209ENST00000530374 KIF27Q86VH2 1401 aa49.73■■■■■ 5.55
CYHR1-209ENST00000530374 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.71■■■■■ 5.55
CYHR1-209ENST00000530374 PCGF6Q9BYE7 350 aa49.63■■■■■ 5.53
CYHR1-209ENST00000530374 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.62■■■■■ 5.53
CYHR1-209ENST00000530374 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.59■■■■■ 5.53
CYHR1-209ENST00000530374 CUX2O14529 1486 aa49.57■■■■■ 5.53
CYHR1-209ENST00000530374 UBTFP17480 764 aaKnown RBP49.52■■■■■ 5.52
CYHR1-209ENST00000530374 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.47■■■■■ 5.51
CYHR1-209ENST00000530374 PRXQ9BXM0 1461 aa49.47■■■■■ 5.51
CYHR1-209ENST00000530374 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.45■■■■■ 5.51
CYHR1-209ENST00000530374 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.41■■■■■ 5.5
CYHR1-209ENST00000530374 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP49.4■■■■■ 5.5
CYHR1-209ENST00000530374 CEP162Q5TB80 1403 aa49.39■■■■■ 5.5
CYHR1-209ENST00000530374 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.38■■■■■ 5.5
CYHR1-209ENST00000530374 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.33■■■■■ 5.49
CYHR1-209ENST00000530374 IGF1RP08069 1367 aa49.3■■■■■ 5.48
CYHR1-209ENST00000530374 WDR97A6NE52 1622 aa49.23■■■■■ 5.47
CYHR1-209ENST00000530374 ERCC6Q03468 1493 aa49.09■■■■■ 5.45
CYHR1-209ENST00000530374 WDR62O43379 1518 aa49.08■■■■■ 5.45
CYHR1-209ENST00000530374 HRCP23327 699 aa49.06■■■■■ 5.44
CYHR1-209ENST00000530374 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
CYHR1-209ENST00000530374 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.04■■■■■ 5.44
CYHR1-209ENST00000530374 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.99■■■■■ 5.43
CYHR1-209ENST00000530374 CLIP1P30622 1438 aa48.96■■■■■ 5.43
CYHR1-209ENST00000530374 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
CYHR1-209ENST00000530374 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
CYHR1-209ENST00000530374 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.89■■■■■ 5.42
CYHR1-209ENST00000530374 CUL7Q14999 1698 aa48.86■■■■■ 5.41
CYHR1-209ENST00000530374 IFT140Q96RY7 1462 aa48.76■■■■■ 5.4
CYHR1-209ENST00000530374 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
CYHR1-209ENST00000530374 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.6■■■■■ 5.37
CYHR1-209ENST00000530374 PBRM1Q86U86 1689 aa48.58■■■■■ 5.37
CYHR1-209ENST00000530374 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.56■■■■■ 5.36
CYHR1-209ENST00000530374 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.53■■■■■ 5.36
CYHR1-209ENST00000530374 ARAP1Q96P48 1450 aa48.48■■■■■ 5.35
CYHR1-209ENST00000530374 GRIN2BQ13224 1484 aa48.46■■■■■ 5.35
CYHR1-209ENST00000530374 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.46■■■■■ 5.35
CYHR1-209ENST00000530374 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa48.43■■■■■ 5.34
CYHR1-209ENST00000530374 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.36■■■■■ 5.33
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