RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329146.8

CRIP2-201, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP2, Length 1,857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-201ENST00000329146 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.78■■■■■ 8.12
CRIP2-201ENST00000329146 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.44■■■■■ 6.79
CRIP2-201ENST00000329146 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.16■■■■■ 6.42
CRIP2-201ENST00000329146 ABCC9O60706 1549 aa54.89■■■■■ 6.38
CRIP2-201ENST00000329146 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.58■■■■■ 6.33
CRIP2-201ENST00000329146 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.32■■■■■ 6.29
CRIP2-201ENST00000329146 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.83■■■■■ 6.21
CRIP2-201ENST00000329146 NACADO15069 1562 aa53.65■■■■■ 6.18
CRIP2-201ENST00000329146 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.47■■■■■ 6.15
CRIP2-201ENST00000329146 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.3■■■■■ 6.12
CRIP2-201ENST00000329146 SCRIBQ14160 1630 aa52.89■■■■■ 6.06
CRIP2-201ENST00000329146 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.21■■■■■ 5.95
CRIP2-201ENST00000329146 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.78■■■■■ 5.88
CRIP2-201ENST00000329146 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.75■■■■■ 5.87
CRIP2-201ENST00000329146 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.64■■■■■ 5.86
CRIP2-201ENST00000329146 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.23■■■■■ 5.79
CRIP2-201ENST00000329146 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.9■■■■■ 5.74
CRIP2-201ENST00000329146 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.84■■■■■ 5.73
CRIP2-201ENST00000329146 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.78■■■■■ 5.72
CRIP2-201ENST00000329146 SMARCA4P51532 1647 aa50.63■■■■■ 5.7
CRIP2-201ENST00000329146 WIZO95785 1651 aa50.37■■■■■ 5.65
CRIP2-201ENST00000329146 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.24■■■■■ 5.63
CRIP2-201ENST00000329146 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.01■■■■■ 5.6
CRIP2-201ENST00000329146 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.96■■■■■ 5.59
CRIP2-201ENST00000329146 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.94■■■■■ 5.58
CRIP2-201ENST00000329146 SMARCA2P51531 1590 aa49.84■■■■■ 5.57
CRIP2-201ENST00000329146 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.8■■■■■ 5.56
CRIP2-201ENST00000329146 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.62■■■■■ 5.53
CRIP2-201ENST00000329146 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.61■■■■■ 5.53
CRIP2-201ENST00000329146 NCAPD3P42695 1498 aa49.58■■■■■ 5.53
CRIP2-201ENST00000329146 HMGXB3Q12766 1538 aa49.42■■■■■ 5.5
CRIP2-201ENST00000329146 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.36■■■■■ 5.49
CRIP2-201ENST00000329146 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.92■■■■■ 5.42
CRIP2-201ENST00000329146 TRIM41Q8WV44 630 aa48.52■■■■■ 5.36
CRIP2-201ENST00000329146 CFTRP13569 1480 aa48.37■■■■■ 5.33
CRIP2-201ENST00000329146 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.3■■■■■ 5.32
CRIP2-201ENST00000329146 ABCC8Q09428 1581 aa48.18■■■■■ 5.3
CRIP2-201ENST00000329146 NESP48681 1621 aa48.07■■■■■ 5.29
CRIP2-201ENST00000329146 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.06■■■■■ 5.28
CRIP2-201ENST00000329146 PRDM2Q13029 1718 aa47.94■■■■■ 5.26
CRIP2-201ENST00000329146 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.91■■■■■ 5.26
CRIP2-201ENST00000329146 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.89■■■■■ 5.26
CRIP2-201ENST00000329146 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.76■■■■■ 5.24
CRIP2-201ENST00000329146 SYNJ1O43426 1573 aa47.73■■■■■ 5.23
CRIP2-201ENST00000329146 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
CRIP2-201ENST00000329146 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.59■■■■■ 5.21
CRIP2-201ENST00000329146 CUX1P39880 1505 aa47.56■■■■■ 5.2
CRIP2-201ENST00000329146 TOP2BQ02880 1626 aa47.52■■■■■ 5.2
CRIP2-201ENST00000329146 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.48■■■■■ 5.19
CRIP2-201ENST00000329146 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.44■■■■■ 5.19
CRIP2-201ENST00000329146 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.39■■■■■ 5.18
CRIP2-201ENST00000329146 SOGA1O94964 1423 aa47.22■■■■■ 5.15
CRIP2-201ENST00000329146 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
CRIP2-201ENST00000329146 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.2■■■■■ 5.15
CRIP2-201ENST00000329146 TOPBP1Q92547 1522 aa47.19■■■■■ 5.15
CRIP2-201ENST00000329146 EEA1Q15075 1411 aa47.15■■■■■ 5.14
CRIP2-201ENST00000329146 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.09■■■■■ 5.13
CRIP2-201ENST00000329146 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.09■■■■■ 5.13
CRIP2-201ENST00000329146 ERCC6Q03468 1493 aa47.06■■■■■ 5.12
CRIP2-201ENST00000329146 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.02■■■■■ 5.12
CRIP2-201ENST00000329146 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.11
CRIP2-201ENST00000329146 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.87■■■■■ 5.09
CRIP2-201ENST00000329146 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.87■■■■■ 5.09
CRIP2-201ENST00000329146 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.83■■■■■ 5.09
CRIP2-201ENST00000329146 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.83■■■■■ 5.09
CRIP2-201ENST00000329146 WDR62O43379 1518 aa46.78■■■■■ 5.08
CRIP2-201ENST00000329146 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
CRIP2-201ENST00000329146 CUX2O14529 1486 aa46.72■■■■■ 5.07
CRIP2-201ENST00000329146 KIF27Q86VH2 1401 aa46.7■■■■■ 5.07
CRIP2-201ENST00000329146 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
CRIP2-201ENST00000329146 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.65■■■■■ 5.06
CRIP2-201ENST00000329146 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.58■■■■■ 5.05
CRIP2-201ENST00000329146 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
CRIP2-201ENST00000329146 GOLGA3Q08378 1498 aa46.49■■■■■ 5.03
CRIP2-201ENST00000329146 WDR97A6NE52 1622 aa46.48■■■■■ 5.03
CRIP2-201ENST00000329146 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
CRIP2-201ENST00000329146 KIF21BO75037 1637 aa46.41■■■■■ 5.02
CRIP2-201ENST00000329146 IGF1RP08069 1367 aa46.4■■■■■ 5.02
CRIP2-201ENST00000329146 IFT140Q96RY7 1462 aa46.37■■■■■ 5.01
CRIP2-201ENST00000329146 CEP162Q5TB80 1403 aa46.34■■■■■ 5.01
CRIP2-201ENST00000329146 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
CRIP2-201ENST00000329146 PRXQ9BXM0 1461 aa46.31■■■■■ 5
CRIP2-201ENST00000329146 HRCP23327 699 aa46.29■■■■■ 5
CRIP2-201ENST00000329146 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.28■■■■■ 5
CRIP2-201ENST00000329146 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.25■■■■■ 4.99
CRIP2-201ENST00000329146 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.25■■■■■ 4.99
CRIP2-201ENST00000329146 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
CRIP2-201ENST00000329146 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.2■■■■■ 4.99
CRIP2-201ENST00000329146 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.13■■■■■ 4.98
CRIP2-201ENST00000329146 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.1■■■■■ 4.97
CRIP2-201ENST00000329146 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
CRIP2-201ENST00000329146 CUL7Q14999 1698 aa45.94■■■■■ 4.95
CRIP2-201ENST00000329146 PBRM1Q86U86 1689 aa45.94■■■■■ 4.95
CRIP2-201ENST00000329146 GRIN2BQ13224 1484 aa45.94■■■■■ 4.94
CRIP2-201ENST00000329146 CLIP1P30622 1438 aa45.79■■■■■ 4.92
CRIP2-201ENST00000329146 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.73■■■■■ 4.91
CRIP2-201ENST00000329146 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.72■■■■■ 4.91
CRIP2-201ENST00000329146 ADAMTS12P58397 1594 aa45.72■■■■■ 4.91
CRIP2-201ENST00000329146 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
CRIP2-201ENST00000329146 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms