RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617066.4

PRR5-217, Transcript of proline rich 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRR5, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-217ENST00000617066 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.82■■■■■ 9.57
PRR5-217ENST00000617066 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa65.45■■■■■ 8.07
PRR5-217ENST00000617066 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.78■■■■■ 7.64
PRR5-217ENST00000617066 ABCC9O60706 1549 aa62.2■■■■■ 7.55
PRR5-217ENST00000617066 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa61.9■■■■■ 7.5
PRR5-217ENST00000617066 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61.79■■■■■ 7.48
PRR5-217ENST00000617066 MYO15BQ96JP2 1530 aa61.33■■■■■ 7.41
PRR5-217ENST00000617066 NACADO15069 1562 aa61.05■■■■■ 7.36
PRR5-217ENST00000617066 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.65■■■■■ 7.3
PRR5-217ENST00000617066 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.6■■■■■ 7.29
PRR5-217ENST00000617066 SCRIBQ14160 1630 aa60.08■■■■■ 7.21
PRR5-217ENST00000617066 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.4■■■■■ 7.1
PRR5-217ENST00000617066 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.82■■■■■ 7.01
PRR5-217ENST00000617066 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.56■■■■■ 6.97
PRR5-217ENST00000617066 CECR2Q9BXF3 1484 aa58.16■■■■■ 6.9
PRR5-217ENST00000617066 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP58.13■■■■■ 6.9
PRR5-217ENST00000617066 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.88■■■■■ 6.86
PRR5-217ENST00000617066 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP57.79■■■■■ 6.84
PRR5-217ENST00000617066 MROH2BQ7Z745 1585 aa57.78■■■■■ 6.84
PRR5-217ENST00000617066 SMARCA4P51532 1647 aa57.6■■■■■ 6.81
PRR5-217ENST00000617066 WIZO95785 1651 aa57.27■■■■■ 6.76
PRR5-217ENST00000617066 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.06■■■■■ 6.72
PRR5-217ENST00000617066 PEG3Q9GZU2 1588 aa56.95■■■■■ 6.71
PRR5-217ENST00000617066 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.77■■■■■ 6.68
PRR5-217ENST00000617066 SMARCA2P51531 1590 aa56.71■■■■■ 6.67
PRR5-217ENST00000617066 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56.69■■■■■ 6.66
PRR5-217ENST00000617066 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP56.39■■■■■ 6.62
PRR5-217ENST00000617066 NCAPD3P42695 1498 aa56.35■■■■■ 6.61
PRR5-217ENST00000617066 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.31■■■■■ 6.61
PRR5-217ENST00000617066 HMGXB3Q12766 1538 aa56.24■■■■■ 6.59
PRR5-217ENST00000617066 CCDC88BA6NC98 1476 aa56.1■■■■■ 6.57
PRR5-217ENST00000617066 CHIC1Q5VXU3 224 aa55.49■■■■■ 6.47
PRR5-217ENST00000617066 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.26■■■■■ 6.44
PRR5-217ENST00000617066 CFTRP13569 1480 aa54.98■■■■■ 6.39
PRR5-217ENST00000617066 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.86■■■■■ 6.37
PRR5-217ENST00000617066 ABCC8Q09428 1581 aa54.75■■■■■ 6.36
PRR5-217ENST00000617066 TRIM41Q8WV44 630 aa54.71■■■■■ 6.35
PRR5-217ENST00000617066 PRDM2Q13029 1718 aa54.68■■■■■ 6.34
PRR5-217ENST00000617066 NESP48681 1621 aa54.5■■■■■ 6.32
PRR5-217ENST00000617066 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.49■■■■■ 6.31
PRR5-217ENST00000617066 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.47■■■■■ 6.315e-6■■■■■ 46
PRR5-217ENST00000617066 SYNJ1O43426 1573 aa54.28■■■■■ 6.28
PRR5-217ENST00000617066 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.24■■■■■ 6.27
PRR5-217ENST00000617066 TOP2BQ02880 1626 aa54.1■■■■■ 6.25
PRR5-217ENST00000617066 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54.06■■■■■ 6.24
PRR5-217ENST00000617066 CUX1P39880 1505 aa54.06■■■■■ 6.24
PRR5-217ENST00000617066 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.06■■■■■ 6.24
PRR5-217ENST00000617066 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.94■■■■■ 6.22
PRR5-217ENST00000617066 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.85■■■■■ 6.21
PRR5-217ENST00000617066 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53.7■■■■■ 6.19
PRR5-217ENST00000617066 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP53.66■■■■■ 6.18
PRR5-217ENST00000617066 SOGA1O94964 1423 aa53.65■■■■■ 6.18
PRR5-217ENST00000617066 TOPBP1Q92547 1522 aa53.63■■■■■ 6.18
PRR5-217ENST00000617066 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.61■■■■■ 6.17
PRR5-217ENST00000617066 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.52■■■■■ 6.16
PRR5-217ENST00000617066 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa53.48■■■■■ 6.15
PRR5-217ENST00000617066 EEA1Q15075 1411 aa53.47■■■■■ 6.15
PRR5-217ENST00000617066 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.41■■■■■ 6.14
PRR5-217ENST00000617066 ERCC6Q03468 1493 aa53.35■■■■■ 6.13
PRR5-217ENST00000617066 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53.33■■■■■ 6.13
PRR5-217ENST00000617066 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa53.32■■■■■ 6.13
PRR5-217ENST00000617066 CSRNP3Q8WYN3 585 aa53.2■■■■■ 6.11
PRR5-217ENST00000617066 WDR62O43379 1518 aa53.16■■■■■ 6.1
PRR5-217ENST00000617066 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53.14■■■■■ 6.1
PRR5-217ENST00000617066 KIF27Q86VH2 1401 aa53.12■■■■■ 6.09
PRR5-217ENST00000617066 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.1■■■■■ 6.09
PRR5-217ENST00000617066 CUX2O14529 1486 aa53.07■■■■■ 6.09
PRR5-217ENST00000617066 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.06■■■■■ 6.08
PRR5-217ENST00000617066 WDR97A6NE52 1622 aa52.94■■■■■ 6.06
PRR5-217ENST00000617066 EHMT2Q96KQ7 1210 aa52.88■■■■■ 6.06
PRR5-217ENST00000617066 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
PRR5-217ENST00000617066 KIF21BO75037 1637 aa52.82■■■■■ 6.05
PRR5-217ENST00000617066 IGF1RP08069 1367 aa52.73■■■■■ 6.03
PRR5-217ENST00000617066 GOLGA3Q08378 1498 aa52.7■■■■■ 6.03
PRR5-217ENST00000617066 PRXQ9BXM0 1461 aa52.7■■■■■ 6.03
PRR5-217ENST00000617066 IFT140Q96RY7 1462 aa52.69■■■■■ 6.03
PRR5-217ENST00000617066 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.66■■■■■ 6.02
PRR5-217ENST00000617066 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.64■■■■■ 6.02
PRR5-217ENST00000617066 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa52.58■■■■■ 6.01
PRR5-217ENST00000617066 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.55■■■■■ 6
PRR5-217ENST00000617066 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.54■■■■■ 6
PRR5-217ENST00000617066 TNIKQ9UKE5 1360 aa52.47■■■■■ 5.99
PRR5-217ENST00000617066 UBTFP17480 764 aaKnown RBP52.43■■■■■ 5.98
PRR5-217ENST00000617066 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52.43■■■■■ 5.98
PRR5-217ENST00000617066 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.42■■■■■ 5.98
PRR5-217ENST00000617066 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.39■■■■■ 5.981e-6■■■■□ 21.9
PRR5-217ENST00000617066 CUL7Q14999 1698 aa52.35■■■■■ 5.97
PRR5-217ENST00000617066 PBRM1Q86U86 1689 aa52.3■■■■■ 5.96
PRR5-217ENST00000617066 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.22■■■■■ 5.95
PRR5-217ENST00000617066 GRIN2BQ13224 1484 aa52.21■■■■■ 5.95
PRR5-217ENST00000617066 CEP162Q5TB80 1403 aa52.15■■■■■ 5.94
PRR5-217ENST00000617066 ADAMTS12P58397 1594 aa52■■■■■ 5.92
PRR5-217ENST00000617066 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.99■■■■■ 5.91
PRR5-217ENST00000617066 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.91■■■■■ 5.9
PRR5-217ENST00000617066 CLIP1P30622 1438 aa51.84■■■■■ 5.89
PRR5-217ENST00000617066 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.82■■■■■ 5.89
PRR5-217ENST00000617066 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.7■■■■■ 5.87
PRR5-217ENST00000617066 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP51.67■■■■■ 5.86
PRR5-217ENST00000617066 SYNJ2O15056 1496 aa51.62■■■■■ 5.85
PRR5-217ENST00000617066 GRIN2AQ12879 1464 aa51.57■■■■■ 5.85
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