RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa78.79■■■■■ 10.2
CSNK1E-204ENST00000403904 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa69.5■■■■■ 8.72
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCC9O60706 1549 aa67.09■■■■■ 8.33
CSNK1E-204ENST00000403904 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP65.85■■■■■ 8.13
CSNK1E-204ENST00000403904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa65.56■■■■■ 8.08
CSNK1E-204ENST00000403904 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa65.15■■■■■ 8.02
CSNK1E-204ENST00000403904 NACADO15069 1562 aa65.09■■■■■ 8.01
CSNK1E-204ENST00000403904 MYO15BQ96JP2 1530 aa64.99■■■■■ 8
CSNK1E-204ENST00000403904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa64.91■■■■■ 7.98
CSNK1E-204ENST00000403904 SCRIBQ14160 1630 aa63.64■■■■■ 7.78
CSNK1E-204ENST00000403904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa63.56■■■■■ 7.77
CSNK1E-204ENST00000403904 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa63.08■■■■■ 7.69
CSNK1E-204ENST00000403904 BICRAQ9NZM4 1560 aa62.96■■■■■ 7.67
CSNK1E-204ENST00000403904 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP62.93■■■■■ 7.66
CSNK1E-204ENST00000403904 CECR2Q9BXF3 1484 aa61.33■■■■■ 7.41
CSNK1E-204ENST00000403904 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP61.2■■■■■ 7.39
CSNK1E-204ENST00000403904 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP60.97■■■■■ 7.35
CSNK1E-204ENST00000403904 SMARCA4P51532 1647 aa60.91■■■■■ 7.34
CSNK1E-204ENST00000403904 MROH2BQ7Z745 1585 aa60.79■■■■■ 7.32
CSNK1E-204ENST00000403904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa60.7■■■■■ 7.31
CSNK1E-204ENST00000403904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60.63■■■■■ 7.3
CSNK1E-204ENST00000403904 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP60.48■■■■■ 7.27
CSNK1E-204ENST00000403904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa60.3■■■■■ 7.24
CSNK1E-204ENST00000403904 PEG3Q9GZU2 1588 aa60.24■■■■■ 7.23
CSNK1E-204ENST00000403904 SMARCA2P51531 1590 aa60.24■■■■■ 7.23
CSNK1E-204ENST00000403904 WIZO95785 1651 aa60.22■■■■■ 7.23
CSNK1E-204ENST00000403904 NCAPD3P42695 1498 aa60.06■■■■■ 7.21
CSNK1E-204ENST00000403904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP59.9■■■■■ 7.18
CSNK1E-204ENST00000403904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP59.87■■■■■ 7.17
CSNK1E-204ENST00000403904 HMGXB3Q12766 1538 aa59.85■■■■■ 7.17
CSNK1E-204ENST00000403904 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP59.56■■■■■ 7.13
CSNK1E-204ENST00000403904 CCDC88BA6NC98 1476 aa58.91■■■■■ 7.02
CSNK1E-204ENST00000403904 CADPSQ9ULU8 1353 aa58.4■■■■■ 6.94
CSNK1E-204ENST00000403904 NESP48681 1621 aa58.4■■■■■ 6.94
CSNK1E-204ENST00000403904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa58.3■■■■■ 6.92
CSNK1E-204ENST00000403904 CFTRP13569 1480 aa58.28■■■■■ 6.92
CSNK1E-204ENST00000403904 PRDM2Q13029 1718 aa57.94■■■■■ 6.87
CSNK1E-204ENST00000403904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa57.88■■■■■ 6.86
CSNK1E-204ENST00000403904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa57.75■■■■■ 6.84
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa57.73■■■■■ 6.83
CSNK1E-204ENST00000403904 ERCC6Q03468 1493 aa57.7■■■■■ 6.83
CSNK1E-204ENST00000403904 CEP164Q9UPV0 1460 aa57.56■■■■■ 6.8
CSNK1E-204ENST00000403904 MRC2Q9UBG0 1479 aa57.23■■■■■ 6.75
CSNK1E-204ENST00000403904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP57.2■■■■■ 6.75
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCC8Q09428 1581 aa57.15■■■■■ 6.74
CSNK1E-204ENST00000403904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP57.12■■■■■ 6.74
CSNK1E-204ENST00000403904 WDR62O43379 1518 aa56.99■■■■■ 6.71
CSNK1E-204ENST00000403904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP56.98■■■■■ 6.71
CSNK1E-204ENST00000403904 DNMBPQ6XZF7 1577 aa56.95■■■■■ 6.71
CSNK1E-204ENST00000403904 CUX1P39880 1505 aa56.95■■■■■ 6.71
CSNK1E-204ENST00000403904 TOPBP1Q92547 1522 aa56.95■■■■■ 6.71
CSNK1E-204ENST00000403904 SYNJ1O43426 1573 aa56.82■■■■■ 6.69
CSNK1E-204ENST00000403904 TOP2BQ02880 1626 aa56.73■■■■■ 6.67
CSNK1E-204ENST00000403904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa56.71■■■■■ 6.67
CSNK1E-204ENST00000403904 CUX2O14529 1486 aa56.6■■■■■ 6.65
CSNK1E-204ENST00000403904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa56.58■■■■■ 6.65
CSNK1E-204ENST00000403904 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP56.55■■■■■ 6.64
CSNK1E-204ENST00000403904 CHIC1Q5VXU3 224 aa56.5■■■■■ 6.64
CSNK1E-204ENST00000403904 TRIM41Q8WV44 630 aa56.46■■■■■ 6.63
CSNK1E-204ENST00000403904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa56.34■■■■■ 6.61
CSNK1E-204ENST00000403904 SOGA1O94964 1423 aa56.34■■■■■ 6.61
CSNK1E-204ENST00000403904 IFT140Q96RY7 1462 aa56.28■■■■■ 6.6
CSNK1E-204ENST00000403904 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP56.24■■■■■ 6.59
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa56.05■■■■■ 6.56
CSNK1E-204ENST00000403904 WDR97A6NE52 1622 aa56.04■■■■■ 6.56
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP56.02■■■■■ 6.56
CSNK1E-204ENST00000403904 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP55.94■■■■■ 6.55
CSNK1E-204ENST00000403904 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP55.85■■■■■ 6.531e-6■■■■□ 24
CSNK1E-204ENST00000403904 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP55.81■■■■■ 6.53
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa55.74■■■■■ 6.51
CSNK1E-204ENST00000403904 GAPVD1Q14C86 1478 aa55.71■■■■■ 6.51
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF27Q86VH2 1401 aa55.69■■■■■ 6.51
CSNK1E-204ENST00000403904 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa55.63■■■■■ 6.5
CSNK1E-204ENST00000403904 PBRM1Q86U86 1689 aa55.53■■■■■ 6.48
CSNK1E-204ENST00000403904 GRIN2BQ13224 1484 aa55.51■■■■■ 6.48
CSNK1E-204ENST00000403904 ERICH3Q5RHP9 1530 aa55.38■■■■■ 6.46
CSNK1E-204ENST00000403904 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP55.36■■■■■ 6.45
CSNK1E-204ENST00000403904 IGF1RP08069 1367 aa55.36■■■■■ 6.45
CSNK1E-204ENST00000403904 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa55.33■■■■■ 6.45
CSNK1E-204ENST00000403904 EEA1Q15075 1411 aa55.3■■■■■ 6.44
CSNK1E-204ENST00000403904 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP55.23■■■■■ 6.43
CSNK1E-204ENST00000403904 CSRNP3Q8WYN3 585 aa55.17■■■■■ 6.42
CSNK1E-204ENST00000403904 ADAMTS12P58397 1594 aa55.13■■■■■ 6.42
CSNK1E-204ENST00000403904 CUL7Q14999 1698 aa55.1■■■■■ 6.41
CSNK1E-204ENST00000403904 FHAD1B1AJZ9 1412 aa55.07■■■■■ 6.41
CSNK1E-204ENST00000403904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa55.05■■■■■ 6.4
CSNK1E-204ENST00000403904 SYNJ2O15056 1496 aa55.03■■■■■ 6.4
CSNK1E-204ENST00000403904 FBLN2P98095 1184 aa55.02■■■■■ 6.4
CSNK1E-204ENST00000403904 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP54.97■■■■■ 6.39
CSNK1E-204ENST00000403904 CHD1O14646 1710 aa54.93■■■■■ 6.38
CSNK1E-204ENST00000403904 PRXQ9BXM0 1461 aa54.9■■■■■ 6.38
CSNK1E-204ENST00000403904 GRIN2AQ12879 1464 aa54.83■■■■■ 6.37
CSNK1E-204ENST00000403904 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa54.83■■■■■ 6.37
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF21BO75037 1637 aa54.69■■■■■ 6.35
CSNK1E-204ENST00000403904 EHMT2Q96KQ7 1210 aa54.63■■■■■ 6.34
CSNK1E-204ENST00000403904 OSCARQ8IYS5 282 aa54.55■■■■■ 6.32
CSNK1E-204ENST00000403904 CEP170Q5SW79 1584 aa54.53■■■■■ 6.32
CSNK1E-204ENST00000403904 NUP160Q12769 1436 aa54.5■■■■■ 6.32
CSNK1E-204ENST00000403904 GOLGA3Q08378 1498 aa54.48■■■■■ 6.31
CSNK1E-204ENST00000403904 UBTFP17480 764 aaKnown RBP54.32■■■■■ 6.29
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