RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.82■■■■■ 9.09
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.2■■■■■ 7.71
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.23■■■■■ 7.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC9O60706 1549 aa59.82■■■■■ 7.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.59■■■■■ 7.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.17■■■■■ 7.06
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.1■■■■■ 7.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NACADO15069 1562 aa58.89■■■■■ 7.02
CAPNS1-206ENST00000588815 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.5■■■■■ 6.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.73■■■■■ 6.83
CAPNS1-206ENST00000588815 SCRIBQ14160 1630 aa57.66■■■■■ 6.82
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.34■■■■■ 6.77
CAPNS1-206ENST00000588815 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.62■■■■■ 6.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.13■■■■■ 6.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.66■■■■■ 6.5
CAPNS1-206ENST00000588815 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.6■■■■■ 6.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCA4P51532 1647 aa55.39■■■■■ 6.46
CAPNS1-206ENST00000588815 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.37■■■■■ 6.45
CAPNS1-206ENST00000588815 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.35■■■■■ 6.45
CAPNS1-206ENST00000588815 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.28■■■■■ 6.44
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.99■■■■■ 6.39
CAPNS1-206ENST00000588815 WIZO95785 1651 aa54.92■■■■■ 6.38
CAPNS1-206ENST00000588815 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.85■■■■■ 6.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCA2P51531 1590 aa54.65■■■■■ 6.34
CAPNS1-206ENST00000588815 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.53■■■■■ 6.32
CAPNS1-206ENST00000588815 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.43■■■■■ 6.3
CAPNS1-206ENST00000588815 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.3■■■■■ 6.28
CAPNS1-206ENST00000588815 NCAPD3P42695 1498 aa54.25■■■■■ 6.27
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGXB3Q12766 1538 aa54.22■■■■■ 6.27
CAPNS1-206ENST00000588815 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.72■■■■■ 6.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.11■■■■■ 6.09
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM2Q13029 1718 aa52.87■■■■■ 6.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CFTRP13569 1480 aa52.85■■■■■ 6.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.74■■■■■ 6.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.73■■■■■ 6.03
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.61■■■■■ 6.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC8Q09428 1581 aa52.33■■■■■ 5.97
CAPNS1-206ENST00000588815 NESP48681 1621 aa52.31■■■■■ 5.96
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM41Q8WV44 630 aa52.18■■■■■ 5.94
CAPNS1-206ENST00000588815 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52.18■■■■■ 5.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.15■■■■■ 5.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.11■■■■■ 5.93
CAPNS1-206ENST00000588815 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.98■■■■■ 5.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNJ1O43426 1573 aa51.98■■■■■ 5.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TOP2BQ02880 1626 aa51.96■■■■■ 5.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.93■■■■■ 5.9
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.93■■■■■ 5.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CUX1P39880 1505 aa51.82■■■■■ 5.89
CAPNS1-206ENST00000588815 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.69■■■■■ 5.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TOPBP1Q92547 1522 aa51.54■■■■■ 5.84
CAPNS1-206ENST00000588815 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.49■■■■■ 5.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC6Q03468 1493 aa51.45■■■■■ 5.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.45■■■■■ 5.83
CAPNS1-206ENST00000588815 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.36■■■■■ 5.81
CAPNS1-206ENST00000588815 EEA1Q15075 1411 aa51.29■■■■■ 5.8
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR62O43379 1518 aa51.26■■■■■ 5.8
CAPNS1-206ENST00000588815 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.24■■■■■ 5.79
CAPNS1-206ENST00000588815 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.21■■■■■ 5.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SOGA1O94964 1423 aa51.18■■■■■ 5.78
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR97A6NE52 1622 aa50.99■■■■■ 5.75
CAPNS1-206ENST00000588815 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.99■■■■■ 5.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.99■■■■■ 5.75
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.97■■■■■ 5.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF27Q86VH2 1401 aa50.96■■■■■ 5.75
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.91■■■■■ 5.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.89■■■■■ 5.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CUX2O14529 1486 aa50.88■■■■■ 5.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CSRNP3Q8WYN3 585 aa50.83■■■■■ 5.73
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT140Q96RY7 1462 aa50.76■■■■■ 5.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.66■■■■■ 5.7
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF21BO75037 1637 aa50.64■■■■■ 5.7
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.5■■■■■ 5.67
CAPNS1-206ENST00000588815 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.5■■■■■ 5.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF1RP08069 1367 aa50.47■■■■■ 5.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.45■■■■■ 5.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PRXQ9BXM0 1461 aa50.45■■■■■ 5.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.44■■■■■ 5.67
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA3Q08378 1498 aa50.43■■■■■ 5.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CUL7Q14999 1698 aa50.42■■■■■ 5.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PBRM1Q86U86 1689 aa50.41■■■■■ 5.66
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.3■■■■■ 5.64
CAPNS1-206ENST00000588815 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.25■■■■■ 5.638e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-206ENST00000588815 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.23■■■■■ 5.63
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIN2BQ13224 1484 aa50.23■■■■■ 5.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.23■■■■■ 5.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TNIKQ9UKE5 1360 aa50.13■■■■■ 5.62
CAPNS1-206ENST00000588815 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.1■■■■■ 5.61
CAPNS1-206ENST00000588815 UBTFP17480 764 aaKnown RBP50.04■■■■■ 5.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS12P58397 1594 aa50.02■■■■■ 5.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.97■■■■■ 5.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.94■■■■■ 5.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.88■■■■■ 5.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.79■■■■■ 5.56
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP162Q5TB80 1403 aa49.74■■■■■ 5.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNJ2O15056 1496 aa49.7■■■■■ 5.55
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIN2AQ12879 1464 aa49.59■■■■■ 5.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CLIP1P30622 1438 aa49.51■■■■■ 5.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.46■■■■■ 5.51
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