RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307257.10

C11orf63-202, Transcript of Uncharacterized protein C11orf63, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C11orf63, Length 1,964 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf63-202ENST00000307257 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.69■■■■■ 7.47
C11orf63-202ENST00000307257 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.56■■■■■ 6
C11orf63-202ENST00000307257 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.29■■■■■ 5.96
C11orf63-202ENST00000307257 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.23■■■■■ 5.95
C11orf63-202ENST00000307257 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.4■■■■■ 5.82
C11orf63-202ENST00000307257 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.9■■■■■ 5.74
C11orf63-202ENST00000307257 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.45■■■■■ 5.67
C11orf63-202ENST00000307257 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.37■■■■■ 5.65
C11orf63-202ENST00000307257 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.17■■■■■ 5.62
C11orf63-202ENST00000307257 ABCC9O60706 1549 aa49.41■■■■■ 5.5
C11orf63-202ENST00000307257 HRCP23327 699 aa49.35■■■■■ 5.49
C11orf63-202ENST00000307257 SCRIBQ14160 1630 aa48.89■■■■■ 5.42
C11orf63-202ENST00000307257 PCGF6Q9BYE7 350 aa48.88■■■■■ 5.42
C11orf63-202ENST00000307257 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.83■■■■■ 5.41
C11orf63-202ENST00000307257 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.64■■■■■ 5.38
C11orf63-202ENST00000307257 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.49■■■■■ 5.35
C11orf63-202ENST00000307257 NACADO15069 1562 aa48.46■■■■■ 5.35
C11orf63-202ENST00000307257 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP48.2■■■■■ 5.31
C11orf63-202ENST00000307257 TRIM41Q8WV44 630 aa48.07■■■■■ 5.29
C11orf63-202ENST00000307257 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.26
C11orf63-202ENST00000307257 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.88■■■■■ 5.26
C11orf63-202ENST00000307257 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.83■■■■■ 5.25
C11orf63-202ENST00000307257 WIZO95785 1651 aa47.58■■■■■ 5.21
C11orf63-202ENST00000307257 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
C11orf63-202ENST00000307257 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
C11orf63-202ENST00000307257 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.38■■■■■ 5.18
C11orf63-202ENST00000307257 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
C11orf63-202ENST00000307257 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
C11orf63-202ENST00000307257 SMARCA4P51532 1647 aa46.93■■■■■ 5.1
C11orf63-202ENST00000307257 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.72■■■■■ 5.07
C11orf63-202ENST00000307257 SMARCA2P51531 1590 aa46.72■■■■■ 5.07
C11orf63-202ENST00000307257 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.72■■■■■ 5.07
C11orf63-202ENST00000307257 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.7■■■■■ 5.07
C11orf63-202ENST00000307257 ABCC8Q09428 1581 aa46.52■■■■■ 5.04
C11orf63-202ENST00000307257 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.43■■■■■ 5.02
C11orf63-202ENST00000307257 EEA1Q15075 1411 aa46.37■■■■■ 5.01
C11orf63-202ENST00000307257 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.23■■■■■ 4.99
C11orf63-202ENST00000307257 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.19■■■■■ 4.99
C11orf63-202ENST00000307257 CEP162Q5TB80 1403 aa46.19■■■■■ 4.98
C11orf63-202ENST00000307257 SOGA1O94964 1423 aa46.15■■■■■ 4.98
C11orf63-202ENST00000307257 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.14■■■■■ 4.98
C11orf63-202ENST00000307257 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.02■■■■■ 4.96
C11orf63-202ENST00000307257 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP45.95■■■■■ 4.95
C11orf63-202ENST00000307257 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
C11orf63-202ENST00000307257 GOLGA3Q08378 1498 aa45.9■■■■■ 4.94
C11orf63-202ENST00000307257 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.86■■■■■ 4.93
C11orf63-202ENST00000307257 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.74■■■■■ 4.91
C11orf63-202ENST00000307257 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
C11orf63-202ENST00000307257 KIF21BO75037 1637 aa45.67■■■■■ 4.9
C11orf63-202ENST00000307257 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.64■■■■■ 4.9
C11orf63-202ENST00000307257 SYNJ1O43426 1573 aa45.61■■■■■ 4.89
C11orf63-202ENST00000307257 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.61■■■■■ 4.89
C11orf63-202ENST00000307257 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
C11orf63-202ENST00000307257 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
C11orf63-202ENST00000307257 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.37■■■■■ 4.85
C11orf63-202ENST00000307257 CLIP1P30622 1438 aa45.29■■■■■ 4.84
C11orf63-202ENST00000307257 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
C11orf63-202ENST00000307257 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
C11orf63-202ENST00000307257 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.2■■■■■ 4.83
C11orf63-202ENST00000307257 TOP2BQ02880 1626 aa45.18■■■■■ 4.82
C11orf63-202ENST00000307257 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
C11orf63-202ENST00000307257 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.07■■■■■ 4.81
C11orf63-202ENST00000307257 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.07■■■■■ 4.8
C11orf63-202ENST00000307257 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.79
C11orf63-202ENST00000307257 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.92■■■■■ 4.78
C11orf63-202ENST00000307257 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
C11orf63-202ENST00000307257 NEUROD1Q13562 356 aa44.87■■■■■ 4.77
C11orf63-202ENST00000307257 APLP2Q06481 763 aa44.86■■■■■ 4.77
C11orf63-202ENST00000307257 HMGXB3Q12766 1538 aa44.86■■■■■ 4.77
C11orf63-202ENST00000307257 PRXQ9BXM0 1461 aa44.78■■■■■ 4.76
C11orf63-202ENST00000307257 NCAPD3P42695 1498 aa44.77■■■■■ 4.76
C11orf63-202ENST00000307257 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
C11orf63-202ENST00000307257 CUX1P39880 1505 aa44.56■■■■■ 4.72
C11orf63-202ENST00000307257 ARAP1Q96P48 1450 aa44.55■■■■■ 4.72
C11orf63-202ENST00000307257 KIF27Q86VH2 1401 aa44.48■■■■■ 4.71
C11orf63-202ENST00000307257 CLSPNQ9HAW4 1339 aa44.47■■■■■ 4.71
C11orf63-202ENST00000307257 CFTRP13569 1480 aa44.45■■■■■ 4.71
C11orf63-202ENST00000307257 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa44.44■■■■■ 4.7
C11orf63-202ENST00000307257 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
C11orf63-202ENST00000307257 PRDM2Q13029 1718 aa44.27■■■■■ 4.68
C11orf63-202ENST00000307257 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
C11orf63-202ENST00000307257 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
C11orf63-202ENST00000307257 MIER1Q8N108 512 aa44.16■■■■■ 4.66
C11orf63-202ENST00000307257 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
C11orf63-202ENST00000307257 CUX2O14529 1486 aa44.12■■■■■ 4.65
C11orf63-202ENST00000307257 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.12■■■■■ 4.65
C11orf63-202ENST00000307257 MAP3K1Q13233 1512 aa43.95■■■■■ 4.63
C11orf63-202ENST00000307257 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.94■■■■■ 4.62
C11orf63-202ENST00000307257 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
C11orf63-202ENST00000307257 IGF1RP08069 1367 aa43.9■■■■■ 4.62
C11orf63-202ENST00000307257 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.84■■■■■ 4.61
C11orf63-202ENST00000307257 TIAM1Q13009 1591 aa43.77■■■■■ 4.6
C11orf63-202ENST00000307257 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.71■■■■■ 4.59
C11orf63-202ENST00000307257 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
C11orf63-202ENST00000307257 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.57■■■■■ 4.56
C11orf63-202ENST00000307257 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.56■■■■■ 4.56
C11orf63-202ENST00000307257 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.5■■■■■ 4.55
C11orf63-202ENST00000307257 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.5■■■■■ 4.55
C11orf63-202ENST00000307257 MAPKBP1O60336 1514 aa43.43■■■■■ 4.54
C11orf63-202ENST00000307257 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.42■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms