RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616327.1

KIAA2013-203, Transcript of KIAA2013, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene KIAA2013, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA2013-203ENST00000616327 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.21■■■■■ 7.87
KIAA2013-203ENST00000616327 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.44■■■■■ 6.47
KIAA2013-203ENST00000616327 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.08■■■■■ 6.25
KIAA2013-203ENST00000616327 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.29■■■■■ 6.12
KIAA2013-203ENST00000616327 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.09■■■■■ 6.09
KIAA2013-203ENST00000616327 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.91■■■■■ 6.06
KIAA2013-203ENST00000616327 ABCC9O60706 1549 aa52.05■■■■■ 5.92
KIAA2013-203ENST00000616327 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.93■■■■■ 5.9
KIAA2013-203ENST00000616327 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.63■■■■■ 5.86
KIAA2013-203ENST00000616327 NACADO15069 1562 aa51.49■■■■■ 5.83
KIAA2013-203ENST00000616327 SCRIBQ14160 1630 aa51.39■■■■■ 5.82
KIAA2013-203ENST00000616327 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.89■■■■■ 5.74
KIAA2013-203ENST00000616327 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.2■■■■■ 5.63
KIAA2013-203ENST00000616327 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.05■■■■■ 5.6
KIAA2013-203ENST00000616327 CECR2Q9BXF3 1484 aa50■■■■■ 5.59
KIAA2013-203ENST00000616327 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.75■■■■■ 5.55
KIAA2013-203ENST00000616327 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.75■■■■■ 5.55
KIAA2013-203ENST00000616327 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.49■■■■■ 5.51
KIAA2013-203ENST00000616327 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.45■■■■■ 5.51
KIAA2013-203ENST00000616327 WIZO95785 1651 aa49.41■■■■■ 5.5
KIAA2013-203ENST00000616327 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.49
KIAA2013-203ENST00000616327 SMARCA4P51532 1647 aa49.19■■■■■ 5.47
KIAA2013-203ENST00000616327 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.76■■■■■ 5.4
KIAA2013-203ENST00000616327 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.45■■■■■ 5.35
KIAA2013-203ENST00000616327 SMARCA2P51531 1590 aa48.4■■■■■ 5.34
KIAA2013-203ENST00000616327 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.4■■■■■ 5.34
KIAA2013-203ENST00000616327 TRIM41Q8WV44 630 aa48.34■■■■■ 5.33
KIAA2013-203ENST00000616327 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.31■■■■■ 5.32
KIAA2013-203ENST00000616327 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.2■■■■■ 5.31
KIAA2013-203ENST00000616327 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.04■■■■■ 5.28
KIAA2013-203ENST00000616327 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
KIAA2013-203ENST00000616327 ABCC8Q09428 1581 aa47.73■■■■■ 5.23
KIAA2013-203ENST00000616327 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.68■■■■■ 5.22
KIAA2013-203ENST00000616327 NCAPD3P42695 1498 aa47.58■■■■■ 5.21
KIAA2013-203ENST00000616327 HMGXB3Q12766 1538 aa47.53■■■■■ 5.2
KIAA2013-203ENST00000616327 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.18■■■■■ 5.145e-6■■■■■ 29.2
KIAA2013-203ENST00000616327 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.13■■■■■ 5.14
KIAA2013-203ENST00000616327 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.03■■■■■ 5.12
KIAA2013-203ENST00000616327 SYNJ1O43426 1573 aa47.02■■■■■ 5.12
KIAA2013-203ENST00000616327 SOGA1O94964 1423 aa47■■■■■ 5.11
KIAA2013-203ENST00000616327 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.82■■■■■ 5.09
KIAA2013-203ENST00000616327 CFTRP13569 1480 aa46.79■■■■■ 5.08
KIAA2013-203ENST00000616327 EEA1Q15075 1411 aa46.77■■■■■ 5.08
KIAA2013-203ENST00000616327 TOP2BQ02880 1626 aa46.66■■■■■ 5.06
KIAA2013-203ENST00000616327 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.64■■■■■ 5.06
KIAA2013-203ENST00000616327 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.63■■■■■ 5.06
KIAA2013-203ENST00000616327 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.57■■■■■ 5.05
KIAA2013-203ENST00000616327 PRDM2Q13029 1718 aa46.5■■■■■ 5.03
KIAA2013-203ENST00000616327 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.48■■■■■ 5.03
KIAA2013-203ENST00000616327 CUX1P39880 1505 aa46.44■■■■■ 5.02
KIAA2013-203ENST00000616327 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.31■■■■■ 5
KIAA2013-203ENST00000616327 GOLGA3Q08378 1498 aa46.28■■■■■ 5
KIAA2013-203ENST00000616327 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
KIAA2013-203ENST00000616327 KIF21BO75037 1637 aa46.2■■■■■ 4.99
KIAA2013-203ENST00000616327 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
KIAA2013-203ENST00000616327 CEP162Q5TB80 1403 aa46.2■■■■■ 4.99
KIAA2013-203ENST00000616327 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.19■■■■■ 4.98
KIAA2013-203ENST00000616327 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46■■■■■ 4.95
KIAA2013-203ENST00000616327 NESP48681 1621 aa45.99■■■■■ 4.95
KIAA2013-203ENST00000616327 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.96■■■■■ 4.95
KIAA2013-203ENST00000616327 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.92■■■■■ 4.94
KIAA2013-203ENST00000616327 KIF27Q86VH2 1401 aa45.88■■■■■ 4.93
KIAA2013-203ENST00000616327 HRCP23327 699 aa45.84■■■■■ 4.93
KIAA2013-203ENST00000616327 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
KIAA2013-203ENST00000616327 PRXQ9BXM0 1461 aa45.8■■■■■ 4.92
KIAA2013-203ENST00000616327 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.79■■■■■ 4.92
KIAA2013-203ENST00000616327 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.79■■■■■ 4.92
KIAA2013-203ENST00000616327 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.72■■■■■ 4.91
KIAA2013-203ENST00000616327 CUX2O14529 1486 aa45.67■■■■■ 4.9
KIAA2013-203ENST00000616327 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.66■■■■■ 4.9
KIAA2013-203ENST00000616327 CLIP1P30622 1438 aa45.64■■■■■ 4.9
KIAA2013-203ENST00000616327 TOPBP1Q92547 1522 aa45.59■■■■■ 4.89
KIAA2013-203ENST00000616327 IGF1RP08069 1367 aa45.48■■■■■ 4.87
KIAA2013-203ENST00000616327 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.45■■■■■ 4.87
KIAA2013-203ENST00000616327 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
KIAA2013-203ENST00000616327 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
KIAA2013-203ENST00000616327 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
KIAA2013-203ENST00000616327 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.41■■■■■ 4.86
KIAA2013-203ENST00000616327 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.34■■■■■ 4.85
KIAA2013-203ENST00000616327 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.33■■■■■ 4.85
KIAA2013-203ENST00000616327 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.31■■■■■ 4.84
KIAA2013-203ENST00000616327 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
KIAA2013-203ENST00000616327 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.24■■■■■ 4.83
KIAA2013-203ENST00000616327 ARAP1Q96P48 1450 aa45.12■■■■■ 4.81
KIAA2013-203ENST00000616327 WDR97A6NE52 1622 aa45.1■■■■■ 4.81
KIAA2013-203ENST00000616327 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.95■■■■■ 4.79
KIAA2013-203ENST00000616327 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
KIAA2013-203ENST00000616327 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.9■■■■■ 4.78
KIAA2013-203ENST00000616327 CUL7Q14999 1698 aa44.89■■■■■ 4.78
KIAA2013-203ENST00000616327 APLP2Q06481 763 aa44.89■■■■■ 4.78
KIAA2013-203ENST00000616327 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.85■■■■■ 4.77
KIAA2013-203ENST00000616327 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
KIAA2013-203ENST00000616327 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.8■■■■■ 4.76
KIAA2013-203ENST00000616327 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
KIAA2013-203ENST00000616327 WDR62O43379 1518 aa44.57■■■■■ 4.73
KIAA2013-203ENST00000616327 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.57■■■■■ 4.73
KIAA2013-203ENST00000616327 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
KIAA2013-203ENST00000616327 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
KIAA2013-203ENST00000616327 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.48■■■■■ 4.711e-11■■■■■ 46.4
KIAA2013-203ENST00000616327 PBRM1Q86U86 1689 aa44.47■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms