RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216727.8

PABPN1-201, Transcript of poly(A) binding protein nuclear 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PABPN1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1-201ENST00000216727 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.38■■■■■ 8.06
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PABPN1-201ENST00000216727 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.06■■■■■ 6.24
PABPN1-201ENST00000216727 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.92■■■■■ 6.22
PABPN1-201ENST00000216727 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.73■■■■■ 6.19
PABPN1-201ENST00000216727 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.11■■■■■ 6.09
PABPN1-201ENST00000216727 ABCC9O60706 1549 aa52.79■■■■■ 6.04
PABPN1-201ENST00000216727 NACADO15069 1562 aa52.51■■■■■ 6
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PABPN1-201ENST00000216727 SCRIBQ14160 1630 aa52.17■■■■■ 5.94
PABPN1-201ENST00000216727 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.85■■■■■ 5.89
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PABPN1-201ENST00000216727 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.76■■■■■ 5.72
PABPN1-201ENST00000216727 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.55■■■■■ 5.68
PABPN1-201ENST00000216727 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.54■■■■■ 5.68
PABPN1-201ENST00000216727 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.4■■■■■ 5.66
PABPN1-201ENST00000216727 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.32■■■■■ 5.65
PABPN1-201ENST00000216727 WIZO95785 1651 aa50.17■■■■■ 5.62
PABPN1-201ENST00000216727 SMARCA4P51532 1647 aa50.06■■■■■ 5.6
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PABPN1-201ENST00000216727 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.44■■■■■ 5.51
PABPN1-201ENST00000216727 SMARCA2P51531 1590 aa49.24■■■■■ 5.47
PABPN1-201ENST00000216727 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.2■■■■■ 5.47
PABPN1-201ENST00000216727 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.18■■■■■ 5.46
PABPN1-201ENST00000216727 TRIM41Q8WV44 630 aa49.12■■■■■ 5.45
PABPN1-201ENST00000216727 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.06■■■■■ 5.44
PABPN1-201ENST00000216727 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.81■■■■■ 5.4
PABPN1-201ENST00000216727 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.64■■■■■ 5.38
PABPN1-201ENST00000216727 NCAPD3P42695 1498 aa48.5■■■■■ 5.36
PABPN1-201ENST00000216727 HMGXB3Q12766 1538 aa48.48■■■■■ 5.35
PABPN1-201ENST00000216727 ABCC8Q09428 1581 aa48.42■■■■■ 5.34
PABPN1-201ENST00000216727 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
PABPN1-201ENST00000216727 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.03■■■■■ 5.28
PABPN1-201ENST00000216727 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.79■■■■■ 5.24
PABPN1-201ENST00000216727 SYNJ1O43426 1573 aa47.78■■■■■ 5.24
PABPN1-201ENST00000216727 EEA1Q15075 1411 aa47.77■■■■■ 5.24
PABPN1-201ENST00000216727 SOGA1O94964 1423 aa47.71■■■■■ 5.23
PABPN1-201ENST00000216727 CFTRP13569 1480 aa47.66■■■■■ 5.22
PABPN1-201ENST00000216727 TOP2BQ02880 1626 aa47.52■■■■■ 5.2
PABPN1-201ENST00000216727 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.52■■■■■ 5.2
PABPN1-201ENST00000216727 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.48■■■■■ 5.19
PABPN1-201ENST00000216727 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.46■■■■■ 5.19
PABPN1-201ENST00000216727 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.45■■■■■ 5.19
PABPN1-201ENST00000216727 PRDM2Q13029 1718 aa47.39■■■■■ 5.18
PABPN1-201ENST00000216727 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.32■■■■■ 5.17
PABPN1-201ENST00000216727 PCGF6Q9BYE7 350 aa47.29■■■■■ 5.16
PABPN1-201ENST00000216727 CUX1P39880 1505 aa47.2■■■■■ 5.15
PABPN1-201ENST00000216727 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.19■■■■■ 5.14
PABPN1-201ENST00000216727 GOLGA3Q08378 1498 aa47.14■■■■■ 5.14
PABPN1-201ENST00000216727 KIF21BO75037 1637 aa47.09■■■■■ 5.13
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PABPN1-201ENST00000216727 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.07■■■■■ 5.13
PABPN1-201ENST00000216727 CEP162Q5TB80 1403 aa46.98■■■■■ 5.11
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PABPN1-201ENST00000216727 KIF27Q86VH2 1401 aa46.74■■■■■ 5.07
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PABPN1-201ENST00000216727 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.64■■■■■ 5.06
PABPN1-201ENST00000216727 NESP48681 1621 aa46.63■■■■■ 5.06
PABPN1-201ENST00000216727 HRCP23327 699 aa46.62■■■■■ 5.05
PABPN1-201ENST00000216727 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.56■■■■■ 5.04
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PABPN1-201ENST00000216727 TOPBP1Q92547 1522 aa46.38■■■■■ 5.01
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PABPN1-201ENST00000216727 IGF1RP08069 1367 aa46.26■■■■■ 5
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PABPN1-201ENST00000216727 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.08■■■■■ 4.97
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PABPN1-201ENST00000216727 WDR97A6NE52 1622 aa45.91■■■■■ 4.94
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PABPN1-201ENST00000216727 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.71■■■■■ 4.91
PABPN1-201ENST00000216727 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
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PABPN1-201ENST00000216727 WDR62O43379 1518 aa45.4■■■■■ 4.86
PABPN1-201ENST00000216727 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.37■■■■■ 4.85
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PABPN1-201ENST00000216727 IFT140Q96RY7 1462 aa45.24■■■■■ 4.83
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PABPN1-201ENST00000216727 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.21■■■■■ 4.83
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