Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNDC9Q8TBE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC9Q8TBE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms