Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZK1P1A8MUH7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1P1A8MUH7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1P1A8MUH7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms