Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR48Q8TAF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR48Q8TAF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR48Q8TAF3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR48Q8TAF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR48Q8TAF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms