RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539813.1

LINC00273-201, long intergenic non-protein coding RNA 273, humanhuman

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Gene LINC00273, Length 1,452 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00273-201ENST00000539813 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.08■■■■■ 7.53
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LINC00273-201ENST00000539813 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.49■■■■■ 5.83
LINC00273-201ENST00000539813 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.48■■■■■ 5.83
LINC00273-201ENST00000539813 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.46■■■■■ 5.83
LINC00273-201ENST00000539813 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.44■■■■■ 5.83
LINC00273-201ENST00000539813 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.44■■■■■ 5.66
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LINC00273-201ENST00000539813 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.46■■■■■ 5.51
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LINC00273-201ENST00000539813 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.26■■■■■ 5.32
LINC00273-201ENST00000539813 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.22■■■■■ 5.31
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LINC00273-201ENST00000539813 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.65■■■■■ 5.22
LINC00273-201ENST00000539813 SMARCA2P51531 1590 aa47.65■■■■■ 5.22
LINC00273-201ENST00000539813 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.64■■■■■ 5.22
LINC00273-201ENST00000539813 NCAPD3P42695 1498 aa47.54■■■■■ 5.2
LINC00273-201ENST00000539813 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
LINC00273-201ENST00000539813 HMGXB3Q12766 1538 aa47.41■■■■■ 5.18
LINC00273-201ENST00000539813 WIZO95785 1651 aa47.39■■■■■ 5.18
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LINC00273-201ENST00000539813 NESP48681 1621 aa46.21■■■■■ 4.99
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LINC00273-201ENST00000539813 PRDM2Q13029 1718 aa45.89■■■■■ 4.94
LINC00273-201ENST00000539813 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.86■■■■■ 4.93
LINC00273-201ENST00000539813 ERCC6Q03468 1493 aa45.81■■■■■ 4.92
LINC00273-201ENST00000539813 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.78■■■■■ 4.92
LINC00273-201ENST00000539813 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.64■■■■■ 4.9
LINC00273-201ENST00000539813 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.55■■■■■ 4.88
LINC00273-201ENST00000539813 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
LINC00273-201ENST00000539813 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.37■■■■■ 4.85
LINC00273-201ENST00000539813 WDR62O43379 1518 aa45.24■■■■■ 4.83
LINC00273-201ENST00000539813 CUX2O14529 1486 aa45.18■■■■■ 4.82
LINC00273-201ENST00000539813 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
LINC00273-201ENST00000539813 ABCC8Q09428 1581 aa45.03■■■■■ 4.8
LINC00273-201ENST00000539813 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.02■■■■■ 4.8
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LINC00273-201ENST00000539813 CUX1P39880 1505 aa44.87■■■■■ 4.77
LINC00273-201ENST00000539813 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.74■■■■■ 4.75
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LINC00273-201ENST00000539813 SYNJ1O43426 1573 aa44.65■■■■■ 4.74
LINC00273-201ENST00000539813 TOP2BQ02880 1626 aa44.65■■■■■ 4.74
LINC00273-201ENST00000539813 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
LINC00273-201ENST00000539813 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.61■■■■■ 4.73
LINC00273-201ENST00000539813 IFT140Q96RY7 1462 aa44.57■■■■■ 4.73
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LINC00273-201ENST00000539813 SOGA1O94964 1423 aa44.43■■■■■ 4.7
LINC00273-201ENST00000539813 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.41■■■■■ 4.7
LINC00273-201ENST00000539813 WDR97A6NE52 1622 aa44.32■■■■■ 4.68
LINC00273-201ENST00000539813 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
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LINC00273-201ENST00000539813 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
LINC00273-201ENST00000539813 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.1■■■■■ 4.65
LINC00273-201ENST00000539813 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
LINC00273-201ENST00000539813 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.04■■■■■ 4.64
LINC00273-201ENST00000539813 TRIM41Q8WV44 630 aa43.98■■■■■ 4.63
LINC00273-201ENST00000539813 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.95■■■■■ 4.63
LINC00273-201ENST00000539813 PBRM1Q86U86 1689 aa43.93■■■■■ 4.62
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LINC00273-201ENST00000539813 KIF27Q86VH2 1401 aa43.76■■■■■ 4.6
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LINC00273-201ENST00000539813 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.72■■■■■ 4.59
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LINC00273-201ENST00000539813 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
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LINC00273-201ENST00000539813 GRIN2AQ12879 1464 aa43.32■■■■■ 4.53
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LINC00273-201ENST00000539813 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.26■■■■■ 4.52
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LINC00273-201ENST00000539813 CEP170Q5SW79 1584 aa43.11■■■■■ 4.49
LINC00273-201ENST00000539813 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.1■■■■■ 4.49
LINC00273-201ENST00000539813 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.09■■■■■ 4.49
LINC00273-201ENST00000539813 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.09■■■■■ 4.49
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LINC00273-201ENST00000539813 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.08■■■■■ 4.49
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LINC00273-201ENST00000539813 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.82■■■■■ 4.45
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