RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.65■■■■■ 7.46
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GKAP1-202ENST00000376365 ABCC9O60706 1549 aa52.88■■■■■ 6.06
GKAP1-202ENST00000376365 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.46■■■■■ 5.83
GKAP1-202ENST00000376365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.38■■■■■ 5.82
GKAP1-202ENST00000376365 NACADO15069 1562 aa51.19■■■■■ 5.79
GKAP1-202ENST00000376365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.13■■■■■ 5.78
GKAP1-202ENST00000376365 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.01■■■■■ 5.76
GKAP1-202ENST00000376365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.01■■■■■ 5.76
GKAP1-202ENST00000376365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.01■■■■■ 5.6
GKAP1-202ENST00000376365 SCRIBQ14160 1630 aa49.89■■■■■ 5.58
GKAP1-202ENST00000376365 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.5■■■■■ 5.51
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GKAP1-202ENST00000376365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.09■■■■■ 5.45
GKAP1-202ENST00000376365 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.3
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GKAP1-202ENST00000376365 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.93■■■■■ 5.26
GKAP1-202ENST00000376365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.86■■■■■ 5.25
GKAP1-202ENST00000376365 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
GKAP1-202ENST00000376365 SMARCA4P51532 1647 aa47.74■■■■■ 5.23
GKAP1-202ENST00000376365 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.51■■■■■ 5.2
GKAP1-202ENST00000376365 SMARCA2P51531 1590 aa47.33■■■■■ 5.17
GKAP1-202ENST00000376365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.3■■■■■ 5.16
GKAP1-202ENST00000376365 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.23■■■■■ 5.15
GKAP1-202ENST00000376365 NCAPD3P42695 1498 aa47.19■■■■■ 5.14
GKAP1-202ENST00000376365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
GKAP1-202ENST00000376365 WIZO95785 1651 aa47.08■■■■■ 5.13
GKAP1-202ENST00000376365 HMGXB3Q12766 1538 aa47.04■■■■■ 5.12
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GKAP1-202ENST00000376365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.91■■■■■ 4.94
GKAP1-202ENST00000376365 NESP48681 1621 aa45.9■■■■■ 4.94
GKAP1-202ENST00000376365 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.86■■■■■ 4.93
GKAP1-202ENST00000376365 CFTRP13569 1480 aa45.7■■■■■ 4.91
GKAP1-202ENST00000376365 ERCC6Q03468 1493 aa45.6■■■■■ 4.89
GKAP1-202ENST00000376365 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.59■■■■■ 4.89
GKAP1-202ENST00000376365 PRDM2Q13029 1718 aa45.51■■■■■ 4.88
GKAP1-202ENST00000376365 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.44■■■■■ 4.86
GKAP1-202ENST00000376365 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.36■■■■■ 4.85
GKAP1-202ENST00000376365 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.28■■■■■ 4.84
GKAP1-202ENST00000376365 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
GKAP1-202ENST00000376365 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.07■■■■■ 4.81
GKAP1-202ENST00000376365 WDR62O43379 1518 aa44.88■■■■■ 4.78
GKAP1-202ENST00000376365 CUX2O14529 1486 aa44.84■■■■■ 4.77
GKAP1-202ENST00000376365 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC8Q09428 1581 aa44.75■■■■■ 4.75
GKAP1-202ENST00000376365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.7■■■■■ 4.75
GKAP1-202ENST00000376365 TOPBP1Q92547 1522 aa44.69■■■■■ 4.74
GKAP1-202ENST00000376365 CUX1P39880 1505 aa44.55■■■■■ 4.72
GKAP1-202ENST00000376365 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.71
GKAP1-202ENST00000376365 SYNJ1O43426 1573 aa44.34■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 TOP2BQ02880 1626 aa44.34■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.34■■■■■ 4.69
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GKAP1-202ENST00000376365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.33■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 IFT140Q96RY7 1462 aa44.28■■■■■ 4.68
GKAP1-202ENST00000376365 SOGA1O94964 1423 aa44.19■■■■■ 4.66
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GKAP1-202ENST00000376365 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
GKAP1-202ENST00000376365 WDR97A6NE52 1622 aa43.94■■■■■ 4.63
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.91■■■■■ 4.62
GKAP1-202ENST00000376365 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
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GKAP1-202ENST00000376365 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
GKAP1-202ENST00000376365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.7■■■■■ 4.59
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GKAP1-202ENST00000376365 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.64■■■■■ 4.58
GKAP1-202ENST00000376365 PBRM1Q86U86 1689 aa43.61■■■■■ 4.57
GKAP1-202ENST00000376365 GRIN2BQ13224 1484 aa43.61■■■■■ 4.57
GKAP1-202ENST00000376365 KIF27Q86VH2 1401 aa43.54■■■■■ 4.56
GKAP1-202ENST00000376365 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.47■■■■■ 4.55
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GKAP1-202ENST00000376365 FBLN2P98095 1184 aa43.28■■■■■ 4.52
GKAP1-202ENST00000376365 CHD1O14646 1710 aa43.28■■■■■ 4.52
GKAP1-202ENST00000376365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.26■■■■■ 4.52
GKAP1-202ENST00000376365 SYNJ2O15056 1496 aa43.26■■■■■ 4.52
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GKAP1-202ENST00000376365 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.2■■■■■ 4.51
GKAP1-202ENST00000376365 CUL7Q14999 1698 aa43.17■■■■■ 4.5
GKAP1-202ENST00000376365 OSCARQ8IYS5 282 aa43.12■■■■■ 4.49
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GKAP1-202ENST00000376365 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.03■■■■■ 4.48
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GKAP1-202ENST00000376365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.93■■■■■ 4.46
GKAP1-202ENST00000376365 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.85■■■■■ 4.45
GKAP1-202ENST00000376365 CEP170Q5SW79 1584 aa42.8■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 PRXQ9BXM0 1461 aa42.79■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 NUP160Q12769 1436 aa42.79■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.78■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.74■■■■■ 4.43
GKAP1-202ENST00000376365 KIF21BO75037 1637 aa42.59■■■■■ 4.41
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.55■■■■■ 4.4
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