RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395785.6

EBAG9-202, Transcript of estrogen receptor binding site associated, antigen, 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EBAG9, Length 1,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9-202ENST00000395785 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.62■■■■■ 7.46
EBAG9-202ENST00000395785 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.26■■■■■ 6.28
EBAG9-202ENST00000395785 ABCC9O60706 1549 aa52.22■■■■■ 5.95
EBAG9-202ENST00000395785 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.84
EBAG9-202ENST00000395785 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.09■■■■■ 5.77
EBAG9-202ENST00000395785 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.99■■■■■ 5.75
EBAG9-202ENST00000395785 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.83■■■■■ 5.73
EBAG9-202ENST00000395785 NACADO15069 1562 aa50.8■■■■■ 5.72
EBAG9-202ENST00000395785 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.59■■■■■ 5.69
EBAG9-202ENST00000395785 SCRIBQ14160 1630 aa49.67■■■■■ 5.54
EBAG9-202ENST00000395785 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.54■■■■■ 5.52
EBAG9-202ENST00000395785 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.37■■■■■ 5.49
EBAG9-202ENST00000395785 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.12■■■■■ 5.45
EBAG9-202ENST00000395785 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49■■■■■ 5.44
EBAG9-202ENST00000395785 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.95■■■■■ 5.27
EBAG9-202ENST00000395785 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
EBAG9-202ENST00000395785 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
EBAG9-202ENST00000395785 SMARCA4P51532 1647 aa47.6■■■■■ 5.21
EBAG9-202ENST00000395785 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.55■■■■■ 5.2
EBAG9-202ENST00000395785 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
EBAG9-202ENST00000395785 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.27■■■■■ 5.16
EBAG9-202ENST00000395785 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.11■■■■■ 5.13
EBAG9-202ENST00000395785 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.1■■■■■ 5.13
EBAG9-202ENST00000395785 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.09■■■■■ 5.13
EBAG9-202ENST00000395785 WIZO95785 1651 aa47.09■■■■■ 5.13
EBAG9-202ENST00000395785 SMARCA2P51531 1590 aa47.03■■■■■ 5.12
EBAG9-202ENST00000395785 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
EBAG9-202ENST00000395785 NCAPD3P42695 1498 aa46.89■■■■■ 5.1
EBAG9-202ENST00000395785 HMGXB3Q12766 1538 aa46.73■■■■■ 5.07
EBAG9-202ENST00000395785 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
EBAG9-202ENST00000395785 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
EBAG9-202ENST00000395785 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.09■■■■■ 4.97
EBAG9-202ENST00000395785 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.59■■■■■ 4.89
EBAG9-202ENST00000395785 CFTRP13569 1480 aa45.53■■■■■ 4.88
EBAG9-202ENST00000395785 NESP48681 1621 aa45.52■■■■■ 4.88
EBAG9-202ENST00000395785 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.46■■■■■ 4.87
EBAG9-202ENST00000395785 PRDM2Q13029 1718 aa45.23■■■■■ 4.83
EBAG9-202ENST00000395785 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.12■■■■■ 4.81
EBAG9-202ENST00000395785 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.06■■■■■ 4.8
EBAG9-202ENST00000395785 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.97■■■■■ 4.79
EBAG9-202ENST00000395785 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.88■■■■■ 4.78
EBAG9-202ENST00000395785 ERCC6Q03468 1493 aa44.87■■■■■ 4.77
EBAG9-202ENST00000395785 ABCC8Q09428 1581 aa44.73■■■■■ 4.75
EBAG9-202ENST00000395785 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.62■■■■■ 4.73
EBAG9-202ENST00000395785 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.6■■■■■ 4.73
EBAG9-202ENST00000395785 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
EBAG9-202ENST00000395785 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
EBAG9-202ENST00000395785 CUX1P39880 1505 aa44.54■■■■■ 4.72
EBAG9-202ENST00000395785 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.48■■■■■ 4.71
EBAG9-202ENST00000395785 TOPBP1Q92547 1522 aa44.48■■■■■ 4.71
EBAG9-202ENST00000395785 SYNJ1O43426 1573 aa44.47■■■■■ 4.71
EBAG9-202ENST00000395785 WDR62O43379 1518 aa44.45■■■■■ 4.71
EBAG9-202ENST00000395785 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.43■■■■■ 4.7
EBAG9-202ENST00000395785 TOP2BQ02880 1626 aa44.38■■■■■ 4.7
EBAG9-202ENST00000395785 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.37■■■■■ 4.69
EBAG9-202ENST00000395785 TRIM41Q8WV44 630 aa44.25■■■■■ 4.67
EBAG9-202ENST00000395785 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.2■■■■■ 4.67
EBAG9-202ENST00000395785 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
EBAG9-202ENST00000395785 CUX2O14529 1486 aa44.07■■■■■ 4.65
EBAG9-202ENST00000395785 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44■■■■■ 4.63
EBAG9-202ENST00000395785 SOGA1O94964 1423 aa43.99■■■■■ 4.63
EBAG9-202ENST00000395785 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
EBAG9-202ENST00000395785 IFT140Q96RY7 1462 aa43.91■■■■■ 4.62
EBAG9-202ENST00000395785 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.82■■■■■ 4.6
EBAG9-202ENST00000395785 WDR97A6NE52 1622 aa43.79■■■■■ 4.6
EBAG9-202ENST00000395785 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.59
EBAG9-202ENST00000395785 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
EBAG9-202ENST00000395785 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.59■■■■■ 4.57
EBAG9-202ENST00000395785 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.57■■■■■ 4.577e-7■□□□□ 11.3
EBAG9-202ENST00000395785 KIF27Q86VH2 1401 aa43.57■■■■■ 4.56
EBAG9-202ENST00000395785 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.56■■■■■ 4.56
EBAG9-202ENST00000395785 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
EBAG9-202ENST00000395785 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.49■■■■■ 4.55
EBAG9-202ENST00000395785 EEA1Q15075 1411 aa43.37■■■■■ 4.53
EBAG9-202ENST00000395785 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
EBAG9-202ENST00000395785 GRIN2BQ13224 1484 aa43.33■■■■■ 4.53
EBAG9-202ENST00000395785 PBRM1Q86U86 1689 aa43.33■■■■■ 4.53
EBAG9-202ENST00000395785 IGF1RP08069 1367 aa43.32■■■■■ 4.53
EBAG9-202ENST00000395785 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.29■■■■■ 4.52
EBAG9-202ENST00000395785 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.23■■■■■ 4.51
EBAG9-202ENST00000395785 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.17■■■■■ 4.5
EBAG9-202ENST00000395785 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
EBAG9-202ENST00000395785 CUL7Q14999 1698 aa43.07■■■■■ 4.49
EBAG9-202ENST00000395785 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.06■■■■■ 4.48
EBAG9-202ENST00000395785 ADAMTS12P58397 1594 aa43.06■■■■■ 4.48
EBAG9-202ENST00000395785 PRXQ9BXM0 1461 aa43.04■■■■■ 4.48
EBAG9-202ENST00000395785 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.02■■■■■ 4.48
EBAG9-202ENST00000395785 SYNJ2O15056 1496 aa42.93■■■■■ 4.46
EBAG9-202ENST00000395785 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.9■■■■■ 4.46
EBAG9-202ENST00000395785 KIF21BO75037 1637 aa42.89■■■■■ 4.46
EBAG9-202ENST00000395785 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
EBAG9-202ENST00000395785 FBLN2P98095 1184 aa42.81■■■■■ 4.44
EBAG9-202ENST00000395785 GRIN2AQ12879 1464 aa42.8■■■■■ 4.44
EBAG9-202ENST00000395785 CHD1O14646 1710 aa42.78■■■■■ 4.44
EBAG9-202ENST00000395785 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.74■■■■■ 4.43
EBAG9-202ENST00000395785 GOLGA3Q08378 1498 aa42.72■■■■■ 4.43
EBAG9-202ENST00000395785 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.65■■■■■ 4.42
EBAG9-202ENST00000395785 NUP160Q12769 1436 aa42.57■■■■■ 4.41
EBAG9-202ENST00000395785 CEP170Q5SW79 1584 aa42.57■■■■■ 4.4
EBAG9-202ENST00000395785 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms