Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CLIP1P30622 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CLIP1P30622 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CLIP1P30622 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CLIP1P30622 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CLIP1P30622 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CLIP1P30622 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CLIP1P30622 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CLIP1P30622 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CLIP1P30622 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms