RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567114.5

RPUSD1-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-208	ENST00000567114	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.6	■■■■■ 7.13
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.3	■■■■■ 5.96
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABCC9	O60706	1549 aa		50.26	■■■■■ 5.64
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.87	■■■■■ 5.57
RPUSD1-208	ENST00000567114	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.63	■■■■■ 5.54
RPUSD1-208	ENST00000567114	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.25	■■■■■ 5.47
RPUSD1-208	ENST00000567114	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.99	■■■■■ 5.43
RPUSD1-208	ENST00000567114	NACAD	O15069	1562 aa		48.95	■■■■■ 5.43
RPUSD1-208	ENST00000567114	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.73	■■■■■ 5.39
RPUSD1-208	ENST00000567114	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.09	■■■■■ 5.29
RPUSD1-208	ENST00000567114	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.01	■■■■■ 5.28
RPUSD1-208	ENST00000567114	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.64	■■■■■ 5.22
RPUSD1-208	ENST00000567114	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.28	■■■■■ 5.16
RPUSD1-208	ENST00000567114	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.22	■■■■■ 5.15
RPUSD1-208	ENST00000567114	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.37	■■■■■ 5.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.08	■■■■■ 4.97
RPUSD1-208	ENST00000567114	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		46	■■■■■ 4.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.96	■■■■■ 4.95
RPUSD1-208	ENST00000567114	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.93	■■■■■ 4.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	45.92	■■■■■ 4.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.91	■■■■■ 4.94
RPUSD1-208	ENST00000567114	WIZ	O95785	1651 aa		45.57	■■■■■ 4.89
RPUSD1-208	ENST00000567114	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.44	■■■■■ 4.87
RPUSD1-208	ENST00000567114	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.44	■■■■■ 4.86
RPUSD1-208	ENST00000567114	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.43	■■■■■ 4.86
RPUSD1-208	ENST00000567114	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.4	■■■■■ 4.86
RPUSD1-208	ENST00000567114	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.2	■■■■■ 4.83
RPUSD1-208	ENST00000567114	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.15	■■■■■ 4.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.09	■■■■■ 4.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.08	■■■■■ 4.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.03	■■■■■ 4.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.64	■■■■■ 4.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.01	■■■■■ 4.64
RPUSD1-208	ENST00000567114	CFTR	P13569	1480 aa		43.97	■■■■■ 4.63
RPUSD1-208	ENST00000567114	NES	P48681	1621 aa		43.85	■■■■■ 4.61
RPUSD1-208	ENST00000567114	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.77	■■■■■ 4.6
RPUSD1-208	ENST00000567114	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.61	■■■■■ 4.57
RPUSD1-208	ENST00000567114	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.53	■■■■■ 4.56
RPUSD1-208	ENST00000567114	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.5	■■■■■ 4.55
RPUSD1-208	ENST00000567114	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.48	■■■■■ 4.55
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.42	■■■■■ 4.54
RPUSD1-208	ENST00000567114	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.31	■■■■■ 4.52
RPUSD1-208	ENST00000567114	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	43.28	■■■■■ 4.52
RPUSD1-208	ENST00000567114	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.27	■■■■■ 4.52
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.25	■■■■■ 4.51
RPUSD1-208	ENST00000567114	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.21	■■■■■ 4.51
RPUSD1-208	ENST00000567114	SYNJ1	O43426	1573 aa		43.07	■■■■■ 4.49
RPUSD1-208	ENST00000567114	CUX1	P39880	1505 aa		43.07	■■■■■ 4.48
RPUSD1-208	ENST00000567114	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.98	■■■■■ 4.47
RPUSD1-208	ENST00000567114	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
RPUSD1-208	ENST00000567114	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.97	■■■■■ 4.47
RPUSD1-208	ENST00000567114	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.93	■■■■■ 4.46
RPUSD1-208	ENST00000567114	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.92	■■■■■ 4.46
RPUSD1-208	ENST00000567114	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.91	■■■■■ 4.46
RPUSD1-208	ENST00000567114	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
RPUSD1-208	ENST00000567114	WDR62	O43379	1518 aa		42.74	■■■■■ 4.43
RPUSD1-208	ENST00000567114	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.74	■■■■■ 4.43
RPUSD1-208	ENST00000567114	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
RPUSD1-208	ENST00000567114	SOGA1	O94964	1423 aa		42.55	■■■■■ 4.4
RPUSD1-208	ENST00000567114	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.52	■■■■■ 4.4
RPUSD1-208	ENST00000567114	CUX2	O14529	1486 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RPUSD1-208	ENST00000567114	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.42	■■■■■ 4.38
RPUSD1-208	ENST00000567114	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RPUSD1-208	ENST00000567114	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.32	■■■■■ 4.37
RPUSD1-208	ENST00000567114	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.36
RPUSD1-208	ENST00000567114	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RPUSD1-208	ENST00000567114	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
RPUSD1-208	ENST00000567114	EEA1	Q15075	1411 aa		42.21	■■■■■ 4.35
RPUSD1-208	ENST00000567114	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RPUSD1-208	ENST00000567114	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.13	■■■■■ 4.33
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
RPUSD1-208	ENST00000567114	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.07	■■■■■ 4.33	8e-8	■■■■■ 39.5
RPUSD1-208	ENST00000567114	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.02	■■■■■ 4.32
RPUSD1-208	ENST00000567114	IGF1R	P08069	1367 aa		41.99	■■■■■ 4.31
RPUSD1-208	ENST00000567114	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.91	■■■■■ 4.3
RPUSD1-208	ENST00000567114	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.87	■■■■■ 4.29
RPUSD1-208	ENST00000567114	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RPUSD1-208	ENST00000567114	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.83	■■■■■ 4.29
RPUSD1-208	ENST00000567114	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.82	■■■■■ 4.29
RPUSD1-208	ENST00000567114	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.79	■■■■■ 4.28
RPUSD1-208	ENST00000567114	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.77	■■■■■ 4.28
RPUSD1-208	ENST00000567114	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.74	■■■■■ 4.27
RPUSD1-208	ENST00000567114	CUL7	Q14999	1698 aa		41.67	■■■■■ 4.26
RPUSD1-208	ENST00000567114	KIF21B	O75037	1637 aa		41.66	■■■■■ 4.26
RPUSD1-208	ENST00000567114	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.64	■■■■■ 4.26
RPUSD1-208	ENST00000567114	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.63	■■■■■ 4.26
RPUSD1-208	ENST00000567114	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.59	■■■■■ 4.25
RPUSD1-208	ENST00000567114	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.58	■■■■■ 4.25
RPUSD1-208	ENST00000567114	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.57	■■■■■ 4.25
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
RPUSD1-208	ENST00000567114	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.54	■■■■■ 4.24
RPUSD1-208	ENST00000567114	FBLN2	P98095	1184 aa		41.46	■■■■■ 4.23
RPUSD1-208	ENST00000567114	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.46	■■■■■ 4.23
RPUSD1-208	ENST00000567114	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.43	■■■■■ 4.22
RPUSD1-208	ENST00000567114	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.32	■■■■■ 4.2
RPUSD1-208	ENST00000567114	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.31	■■■■■ 4.2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CHD1	O14646	1710 aa		41.16	■■■■■ 4.18
RPUSD1-208	ENST00000567114	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.14	■■■■■ 4.18

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