RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260386.6

ITPKA-201, Transcript of inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITPKA, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKA-201ENST00000260386 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.05■■■■■ 7.2
ITPKA-201ENST00000260386 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.75■■■■■ 6.03
ITPKA-201ENST00000260386 ABCC9O60706 1549 aa50.36■■■■■ 5.65
ITPKA-201ENST00000260386 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.32■■■■■ 5.65
ITPKA-201ENST00000260386 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.76■■■■■ 5.56
ITPKA-201ENST00000260386 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.57■■■■■ 5.53
ITPKA-201ENST00000260386 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.47■■■■■ 5.51
ITPKA-201ENST00000260386 NACADO15069 1562 aa49.29■■■■■ 5.48
ITPKA-201ENST00000260386 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.01■■■■■ 5.44
ITPKA-201ENST00000260386 SCRIBQ14160 1630 aa48.25■■■■■ 5.32
ITPKA-201ENST00000260386 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.25■■■■■ 5.31
ITPKA-201ENST00000260386 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.93■■■■■ 5.26
ITPKA-201ENST00000260386 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.54■■■■■ 5.2
ITPKA-201ENST00000260386 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.3■■■■■ 5.16
ITPKA-201ENST00000260386 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.65■■■■■ 5.06
ITPKA-201ENST00000260386 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.43■■■■■ 5.02
ITPKA-201ENST00000260386 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.31■■■■■ 5
ITPKA-201ENST00000260386 SMARCA4P51532 1647 aa46.3■■■■■ 5
ITPKA-201ENST00000260386 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
ITPKA-201ENST00000260386 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
ITPKA-201ENST00000260386 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
ITPKA-201ENST00000260386 WIZO95785 1651 aa45.86■■■■■ 4.93
ITPKA-201ENST00000260386 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.86■■■■■ 4.93
ITPKA-201ENST00000260386 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.73■■■■■ 4.91
ITPKA-201ENST00000260386 SMARCA2P51531 1590 aa45.7■■■■■ 4.91
ITPKA-201ENST00000260386 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.62■■■■■ 4.89
ITPKA-201ENST00000260386 NCAPD3P42695 1498 aa45.51■■■■■ 4.88
ITPKA-201ENST00000260386 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
ITPKA-201ENST00000260386 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
ITPKA-201ENST00000260386 HMGXB3Q12766 1538 aa45.39■■■■■ 4.86
ITPKA-201ENST00000260386 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.07■■■■■ 4.81
ITPKA-201ENST00000260386 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.93■■■■■ 4.78
ITPKA-201ENST00000260386 CFTRP13569 1480 aa44.28■■■■■ 4.68
ITPKA-201ENST00000260386 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.25■■■■■ 4.67
ITPKA-201ENST00000260386 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.06■■■■■ 4.64
ITPKA-201ENST00000260386 NESP48681 1621 aa44■■■■■ 4.63
ITPKA-201ENST00000260386 PRDM2Q13029 1718 aa43.97■■■■■ 4.63
ITPKA-201ENST00000260386 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.83■■■■■ 4.61
ITPKA-201ENST00000260386 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.72■■■■■ 4.59
ITPKA-201ENST00000260386 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.71■■■■■ 4.59
ITPKA-201ENST00000260386 ABCC8Q09428 1581 aa43.69■■■■■ 4.58
ITPKA-201ENST00000260386 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.58■■■■■ 4.57
ITPKA-201ENST00000260386 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.52■■■■■ 4.56
ITPKA-201ENST00000260386 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.48■■■■■ 4.55
ITPKA-201ENST00000260386 TRIM41Q8WV44 630 aa43.45■■■■■ 4.55
ITPKA-201ENST00000260386 SYNJ1O43426 1573 aa43.4■■■■■ 4.54
ITPKA-201ENST00000260386 CUX1P39880 1505 aa43.36■■■■■ 4.53
ITPKA-201ENST00000260386 TOP2BQ02880 1626 aa43.34■■■■■ 4.53
ITPKA-201ENST00000260386 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.3■■■■■ 4.52
ITPKA-201ENST00000260386 ERCC6Q03468 1493 aa43.27■■■■■ 4.52
ITPKA-201ENST00000260386 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.23■■■■■ 4.51
ITPKA-201ENST00000260386 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
ITPKA-201ENST00000260386 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.18■■■■■ 4.5
ITPKA-201ENST00000260386 TOPBP1Q92547 1522 aa43.18■■■■■ 4.5
ITPKA-201ENST00000260386 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
ITPKA-201ENST00000260386 WDR62O43379 1518 aa43.02■■■■■ 4.48
ITPKA-201ENST00000260386 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.99■■■■■ 4.47
ITPKA-201ENST00000260386 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
ITPKA-201ENST00000260386 SOGA1O94964 1423 aa42.74■■■■■ 4.43
ITPKA-201ENST00000260386 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.71■■■■■ 4.43
ITPKA-201ENST00000260386 CUX2O14529 1486 aa42.69■■■■■ 4.42
ITPKA-201ENST00000260386 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.66■■■■■ 4.42
ITPKA-201ENST00000260386 EEA1Q15075 1411 aa42.62■■■■■ 4.41
ITPKA-201ENST00000260386 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
ITPKA-201ENST00000260386 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.61■■■■■ 4.41
ITPKA-201ENST00000260386 WDR97A6NE52 1622 aa42.57■■■■■ 4.41
ITPKA-201ENST00000260386 IFT140Q96RY7 1462 aa42.56■■■■■ 4.4
ITPKA-201ENST00000260386 KIF27Q86VH2 1401 aa42.54■■■■■ 4.4
ITPKA-201ENST00000260386 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
ITPKA-201ENST00000260386 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.37■■■■■ 4.37
ITPKA-201ENST00000260386 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.36■■■■■ 4.37
ITPKA-201ENST00000260386 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
ITPKA-201ENST00000260386 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
ITPKA-201ENST00000260386 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.27■■■■■ 4.36
ITPKA-201ENST00000260386 IGF1RP08069 1367 aa42.25■■■■■ 4.35
ITPKA-201ENST00000260386 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.22■■■■■ 4.35
ITPKA-201ENST00000260386 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
ITPKA-201ENST00000260386 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.15■■■■■ 4.34
ITPKA-201ENST00000260386 PRXQ9BXM0 1461 aa42.12■■■■■ 4.33
ITPKA-201ENST00000260386 KIF21BO75037 1637 aa42.08■■■■■ 4.33
ITPKA-201ENST00000260386 GRIN2BQ13224 1484 aa42.07■■■■■ 4.33
ITPKA-201ENST00000260386 PBRM1Q86U86 1689 aa42.06■■■■■ 4.32
ITPKA-201ENST00000260386 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.02■■■■■ 4.32
ITPKA-201ENST00000260386 CUL7Q14999 1698 aa42■■■■■ 4.31
ITPKA-201ENST00000260386 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42■■■■■ 4.31
ITPKA-201ENST00000260386 GOLGA3Q08378 1498 aa41.94■■■■■ 4.3
ITPKA-201ENST00000260386 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.92■■■■■ 4.3
ITPKA-201ENST00000260386 ADAMTS12P58397 1594 aa41.85■■■■■ 4.29
ITPKA-201ENST00000260386 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.84■■■■■ 4.29
ITPKA-201ENST00000260386 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.83■■■■■ 4.29
ITPKA-201ENST00000260386 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
ITPKA-201ENST00000260386 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.83■■■■■ 4.29
ITPKA-201ENST00000260386 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.69■■■■■ 4.26
ITPKA-201ENST00000260386 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
ITPKA-201ENST00000260386 SYNJ2O15056 1496 aa41.66■■■■■ 4.26
ITPKA-201ENST00000260386 GRIN2AQ12879 1464 aa41.55■■■■■ 4.24
ITPKA-201ENST00000260386 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.23
ITPKA-201ENST00000260386 FBLN2P98095 1184 aa41.4■■■■■ 4.22
ITPKA-201ENST00000260386 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.38■■■■■ 4.22
ITPKA-201ENST00000260386 CEP162Q5TB80 1403 aa41.37■■■■■ 4.21
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