RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437945.5

MEST-211, mesoderm specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MEST, Length 1,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEST-211ENST00000437945 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.11■■■■■ 7.21
MEST-211ENST00000437945 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.94■■■■■ 6.07
MEST-211ENST00000437945 ABCC9O60706 1549 aa50.74■■■■■ 5.71
MEST-211ENST00000437945 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.64
MEST-211ENST00000437945 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.82■■■■■ 5.57
MEST-211ENST00000437945 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.79■■■■■ 5.56
MEST-211ENST00000437945 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.64■■■■■ 5.54
MEST-211ENST00000437945 NACADO15069 1562 aa49.55■■■■■ 5.52
MEST-211ENST00000437945 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.33■■■■■ 5.49
MEST-211ENST00000437945 SCRIBQ14160 1630 aa48.38■■■■■ 5.34
MEST-211ENST00000437945 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.14■■■■■ 5.3
MEST-211ENST00000437945 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.13■■■■■ 5.3
MEST-211ENST00000437945 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.74■■■■■ 5.23
MEST-211ENST00000437945 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.62■■■■■ 5.21
MEST-211ENST00000437945 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.68■■■■■ 5.06
MEST-211ENST00000437945 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
MEST-211ENST00000437945 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
MEST-211ENST00000437945 SMARCA4P51532 1647 aa46.39■■■■■ 5.02
MEST-211ENST00000437945 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.32■■■■■ 5.01
MEST-211ENST00000437945 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
MEST-211ENST00000437945 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.95■■■■■ 4.95
MEST-211ENST00000437945 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.95■■■■■ 4.95
MEST-211ENST00000437945 SMARCA2P51531 1590 aa45.9■■■■■ 4.94
MEST-211ENST00000437945 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.89■■■■■ 4.94
MEST-211ENST00000437945 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
MEST-211ENST00000437945 WIZO95785 1651 aa45.86■■■■■ 4.93
MEST-211ENST00000437945 NCAPD3P42695 1498 aa45.71■■■■■ 4.91
MEST-211ENST00000437945 HMGXB3Q12766 1538 aa45.58■■■■■ 4.89
MEST-211ENST00000437945 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
MEST-211ENST00000437945 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.56■■■■■ 4.88
MEST-211ENST00000437945 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
MEST-211ENST00000437945 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.94■■■■■ 4.79
MEST-211ENST00000437945 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.45■■■■■ 4.71
MEST-211ENST00000437945 CFTRP13569 1480 aa44.41■■■■■ 4.7
MEST-211ENST00000437945 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.32■■■■■ 4.69
MEST-211ENST00000437945 NESP48681 1621 aa44.22■■■■■ 4.67
MEST-211ENST00000437945 PRDM2Q13029 1718 aa44.1■■■■■ 4.65
MEST-211ENST00000437945 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.02■■■■■ 4.64
MEST-211ENST00000437945 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.91■■■■■ 4.62
MEST-211ENST00000437945 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.76■■■■■ 4.6
MEST-211ENST00000437945 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.71■■■■■ 4.59
MEST-211ENST00000437945 ERCC6Q03468 1493 aa43.69■■■■■ 4.58
MEST-211ENST00000437945 ABCC8Q09428 1581 aa43.59■■■■■ 4.57
MEST-211ENST00000437945 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.57■■■■■ 4.56
MEST-211ENST00000437945 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.48■■■■■ 4.55
MEST-211ENST00000437945 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.47■■■■■ 4.55
MEST-211ENST00000437945 CUX1P39880 1505 aa43.4■■■■■ 4.54
MEST-211ENST00000437945 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
MEST-211ENST00000437945 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.38■■■■■ 4.53
MEST-211ENST00000437945 SYNJ1O43426 1573 aa43.35■■■■■ 4.53
MEST-211ENST00000437945 TOPBP1Q92547 1522 aa43.33■■■■■ 4.53
MEST-211ENST00000437945 TOP2BQ02880 1626 aa43.33■■■■■ 4.53
MEST-211ENST00000437945 TRIM41Q8WV44 630 aa43.32■■■■■ 4.52
MEST-211ENST00000437945 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
MEST-211ENST00000437945 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.3■■■■■ 4.52
MEST-211ENST00000437945 WDR62O43379 1518 aa43.28■■■■■ 4.52
MEST-211ENST00000437945 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.09■■■■■ 4.49
MEST-211ENST00000437945 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
MEST-211ENST00000437945 SOGA1O94964 1423 aa42.9■■■■■ 4.46
MEST-211ENST00000437945 CUX2O14529 1486 aa42.87■■■■■ 4.45
MEST-211ENST00000437945 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.82■■■■■ 4.45
MEST-211ENST00000437945 IFT140Q96RY7 1462 aa42.81■■■■■ 4.44
MEST-211ENST00000437945 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.76■■■■■ 4.43
MEST-211ENST00000437945 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
MEST-211ENST00000437945 WDR97A6NE52 1622 aa42.65■■■■■ 4.42
MEST-211ENST00000437945 KIF27Q86VH2 1401 aa42.59■■■■■ 4.41
MEST-211ENST00000437945 EEA1Q15075 1411 aa42.53■■■■■ 4.4
MEST-211ENST00000437945 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
MEST-211ENST00000437945 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
MEST-211ENST00000437945 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.46■■■■■ 4.39
MEST-211ENST00000437945 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.44■■■■■ 4.39
MEST-211ENST00000437945 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.43■■■■■ 4.38
MEST-211ENST00000437945 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
MEST-211ENST00000437945 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
MEST-211ENST00000437945 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
MEST-211ENST00000437945 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.29■■■■■ 4.36
MEST-211ENST00000437945 GRIN2BQ13224 1484 aa42.27■■■■■ 4.36
MEST-211ENST00000437945 IGF1RP08069 1367 aa42.27■■■■■ 4.36
MEST-211ENST00000437945 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.26■■■■■ 4.36
MEST-211ENST00000437945 PBRM1Q86U86 1689 aa42.21■■■■■ 4.35
MEST-211ENST00000437945 CUL7Q14999 1698 aa42.08■■■■■ 4.33
MEST-211ENST00000437945 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
MEST-211ENST00000437945 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.05■■■■■ 4.32
MEST-211ENST00000437945 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.04■■■■■ 4.32
MEST-211ENST00000437945 PRXQ9BXM0 1461 aa42.03■■■■■ 4.32
MEST-211ENST00000437945 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.99■■■■■ 4.31
MEST-211ENST00000437945 ADAMTS12P58397 1594 aa41.96■■■■■ 4.31
MEST-211ENST00000437945 KIF21BO75037 1637 aa41.95■■■■■ 4.31
MEST-211ENST00000437945 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.92■■■■■ 4.3
MEST-211ENST00000437945 SYNJ2O15056 1496 aa41.87■■■■■ 4.29
MEST-211ENST00000437945 GOLGA3Q08378 1498 aa41.81■■■■■ 4.28
MEST-211ENST00000437945 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
MEST-211ENST00000437945 GRIN2AQ12879 1464 aa41.72■■■■■ 4.27
MEST-211ENST00000437945 FBLN2P98095 1184 aa41.7■■■■■ 4.27
MEST-211ENST00000437945 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.67■■■■■ 4.26
MEST-211ENST00000437945 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.67■■■■■ 4.26
MEST-211ENST00000437945 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
MEST-211ENST00000437945 CHD1O14646 1710 aa41.59■■■■■ 4.25
MEST-211ENST00000437945 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.51■■■■■ 4.24
MEST-211ENST00000437945 NUP160Q12769 1436 aa41.49■■■■■ 4.23
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