Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms