Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM16Q9HAZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM16Q9HAZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM16Q9HAZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM16Q9HAZ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms