Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHLDB3Q6NSJ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHLDB3Q6NSJ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHLDB3Q6NSJ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHLDB3Q6NSJ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms