Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COLEC12Q5KU26 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLEC12Q5KU26 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLEC12Q5KU26 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms