RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309657.7

RCE1-201, Transcript of Ras converting CAAX endopeptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCE1, Length 1,485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1-201ENST00000309657 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.03■■■■■ 7.84
RCE1-201ENST00000309657 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.84■■■■■ 6.69
RCE1-201ENST00000309657 ABCC9O60706 1549 aa55.63■■■■■ 6.5
RCE1-201ENST00000309657 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.46■■■■■ 6.15
RCE1-201ENST00000309657 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.42■■■■■ 6.14
RCE1-201ENST00000309657 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.38■■■■■ 6.14
RCE1-201ENST00000309657 NACADO15069 1562 aa53.36■■■■■ 6.13
RCE1-201ENST00000309657 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.02■■■■■ 6.08
RCE1-201ENST00000309657 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.89■■■■■ 6.06
RCE1-201ENST00000309657 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.43■■■■■ 5.98
RCE1-201ENST00000309657 SCRIBQ14160 1630 aa52.01■■■■■ 5.92
RCE1-201ENST00000309657 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.01■■■■■ 5.92
RCE1-201ENST00000309657 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.96■■■■■ 5.91
RCE1-201ENST00000309657 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.14■■■■■ 5.78
RCE1-201ENST00000309657 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.03■■■■■ 5.76
RCE1-201ENST00000309657 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
RCE1-201ENST00000309657 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.3■■■■■ 5.64
RCE1-201ENST00000309657 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.99■■■■■ 5.59
RCE1-201ENST00000309657 SMARCA4P51532 1647 aa49.7■■■■■ 5.55
RCE1-201ENST00000309657 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.57■■■■■ 5.53
RCE1-201ENST00000309657 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.44■■■■■ 5.51
RCE1-201ENST00000309657 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.37■■■■■ 5.49
RCE1-201ENST00000309657 NCAPD3P42695 1498 aa49.26■■■■■ 5.48
RCE1-201ENST00000309657 SMARCA2P51531 1590 aa49.23■■■■■ 5.47
RCE1-201ENST00000309657 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.14■■■■■ 5.46
RCE1-201ENST00000309657 HMGXB3Q12766 1538 aa49.04■■■■■ 5.44
RCE1-201ENST00000309657 WIZO95785 1651 aa48.95■■■■■ 5.43
RCE1-201ENST00000309657 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
RCE1-201ENST00000309657 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.86■■■■■ 5.41
RCE1-201ENST00000309657 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
RCE1-201ENST00000309657 NESP48681 1621 aa48.23■■■■■ 5.31
RCE1-201ENST00000309657 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.95■■■■■ 5.27
RCE1-201ENST00000309657 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.83■■■■■ 5.25
RCE1-201ENST00000309657 ERCC6Q03468 1493 aa47.82■■■■■ 5.25
RCE1-201ENST00000309657 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.79■■■■■ 5.24
RCE1-201ENST00000309657 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
RCE1-201ENST00000309657 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.65■■■■■ 5.22
RCE1-201ENST00000309657 CFTRP13569 1480 aa47.6■■■■■ 5.21
RCE1-201ENST00000309657 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.57■■■■■ 5.2
RCE1-201ENST00000309657 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
RCE1-201ENST00000309657 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.34■■■■■ 5.17
RCE1-201ENST00000309657 PRDM2Q13029 1718 aa47.31■■■■■ 5.16
RCE1-201ENST00000309657 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.24■■■■■ 5.15
RCE1-201ENST00000309657 CUX2O14529 1486 aa47.22■■■■■ 5.15
RCE1-201ENST00000309657 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.15■■■■■ 5.14
RCE1-201ENST00000309657 WDR62O43379 1518 aa47.01■■■■■ 5.12
RCE1-201ENST00000309657 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
RCE1-201ENST00000309657 TOPBP1Q92547 1522 aa46.62■■■■■ 5.05
RCE1-201ENST00000309657 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.55■■■■■ 5.04
RCE1-201ENST00000309657 ABCC8Q09428 1581 aa46.44■■■■■ 5.02
RCE1-201ENST00000309657 CUX1P39880 1505 aa46.37■■■■■ 5.01
RCE1-201ENST00000309657 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.24■■■■■ 4.99
RCE1-201ENST00000309657 IFT140Q96RY7 1462 aa46.21■■■■■ 4.99
RCE1-201ENST00000309657 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
RCE1-201ENST00000309657 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.15■■■■■ 4.98
RCE1-201ENST00000309657 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.98
RCE1-201ENST00000309657 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.09■■■■■ 4.97
RCE1-201ENST00000309657 SYNJ1O43426 1573 aa46.02■■■■■ 4.96
RCE1-201ENST00000309657 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.01■■■■■ 4.96
RCE1-201ENST00000309657 SOGA1O94964 1423 aa46■■■■■ 4.95
RCE1-201ENST00000309657 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.95■■■■■ 4.95
RCE1-201ENST00000309657 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
RCE1-201ENST00000309657 TOP2BQ02880 1626 aa45.94■■■■■ 4.94
RCE1-201ENST00000309657 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.86■■■■■ 4.935e-7■■■■□ 22.3
RCE1-201ENST00000309657 WDR97A6NE52 1622 aa45.81■■■■■ 4.92
RCE1-201ENST00000309657 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
RCE1-201ENST00000309657 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.68■■■■■ 4.9
RCE1-201ENST00000309657 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.65■■■■■ 4.9
RCE1-201ENST00000309657 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.53■■■■■ 4.88
RCE1-201ENST00000309657 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.47■■■■■ 4.87
RCE1-201ENST00000309657 PBRM1Q86U86 1689 aa45.47■■■■■ 4.87
RCE1-201ENST00000309657 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.44■■■■■ 4.86
RCE1-201ENST00000309657 GRIN2BQ13224 1484 aa45.42■■■■■ 4.86
RCE1-201ENST00000309657 CHD1O14646 1710 aa45.38■■■■■ 4.86
RCE1-201ENST00000309657 OSCARQ8IYS5 282 aa45.27■■■■■ 4.84
RCE1-201ENST00000309657 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
RCE1-201ENST00000309657 FBLN2P98095 1184 aa45.23■■■■■ 4.83
RCE1-201ENST00000309657 SYNJ2O15056 1496 aa45.12■■■■■ 4.81
RCE1-201ENST00000309657 ADAMTS12P58397 1594 aa45.09■■■■■ 4.81
RCE1-201ENST00000309657 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.07■■■■■ 4.81
RCE1-201ENST00000309657 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
RCE1-201ENST00000309657 KIF27Q86VH2 1401 aa44.99■■■■■ 4.79
RCE1-201ENST00000309657 TRIM41Q8WV44 630 aa44.98■■■■■ 4.79
RCE1-201ENST00000309657 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.91■■■■■ 4.78
RCE1-201ENST00000309657 GRIN2AQ12879 1464 aa44.88■■■■■ 4.78
RCE1-201ENST00000309657 IGF1RP08069 1367 aa44.86■■■■■ 4.77
RCE1-201ENST00000309657 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.86■■■■■ 4.77
RCE1-201ENST00000309657 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.83■■■■■ 4.77
RCE1-201ENST00000309657 CEP170Q5SW79 1584 aa44.74■■■■■ 4.75
RCE1-201ENST00000309657 CUL7Q14999 1698 aa44.71■■■■■ 4.75
RCE1-201ENST00000309657 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.71■■■■■ 4.75
RCE1-201ENST00000309657 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.71■■■■■ 4.75
RCE1-201ENST00000309657 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.71■■■■■ 4.75
RCE1-201ENST00000309657 ARHGEF11O15085 1522 aa44.67■■■■■ 4.74
RCE1-201ENST00000309657 NUP160Q12769 1436 aa44.66■■■■■ 4.74
RCE1-201ENST00000309657 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.61■■■■■ 4.73
RCE1-201ENST00000309657 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.57■■■■■ 4.72
RCE1-201ENST00000309657 ARAP1Q96P48 1450 aa44.36■■■■■ 4.69
RCE1-201ENST00000309657 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.36■■■■■ 4.69
RCE1-201ENST00000309657 SHROOM2Q13796 1616 aa44.36■■■■■ 4.69
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