Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J1Q9Y385 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J1Q9Y385 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J1Q9Y385 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J1Q9Y385 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2J1Q9Y385 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J1Q9Y385 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms