Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ELL3Q9HB65 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL3Q9HB65 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELL3Q9HB65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL3Q9HB65 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms