Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP2Q9BQI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP2Q9BQI9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRIP2Q9BQI9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP2Q9BQI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP2Q9BQI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms