Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4LQ96PU5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4LQ96PU5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD4LQ96PU5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4LQ96PU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms