Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms