Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GCC1Q96CN9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCC1Q96CN9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCC1Q96CN9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GCC1Q96CN9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GCC1Q96CN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GCC1Q96CN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms