Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB8BQ92930 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB8BQ92930 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB8BQ92930 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB8BQ92930 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8BQ92930 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB8BQ92930 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB8BQ92930 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms