Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB8BQ92930 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAB8BQ92930 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RAB8BQ92930 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB8BQ92930 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB8BQ92930 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RAB8BQ92930 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RAB8BQ92930 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RAB8BQ92930 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAB8BQ92930 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RAB8BQ92930 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAB8BQ92930 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB8BQ92930 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB8BQ92930 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB8BQ92930 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB8BQ92930 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAB8BQ92930 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB8BQ92930 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB8BQ92930 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB8BQ92930 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB8BQ92930 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB8BQ92930 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB8BQ92930 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB8BQ92930 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB8BQ92930 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB8BQ92930 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB8BQ92930 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB8BQ92930 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB8BQ92930 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB8BQ92930 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB8BQ92930 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB8BQ92930 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB8BQ92930 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB8BQ92930 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB8BQ92930 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB8BQ92930 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB8BQ92930 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB8BQ92930 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB8BQ92930 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB8BQ92930 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB8BQ92930 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAB8BQ92930 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB8BQ92930 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB8BQ92930 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB8BQ92930 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB8BQ92930 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB8BQ92930 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB8BQ92930 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB8BQ92930 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAB8BQ92930 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB8BQ92930 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB8BQ92930 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB8BQ92930 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB8BQ92930 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB8BQ92930 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB8BQ92930 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB8BQ92930 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB8BQ92930 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB8BQ92930 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB8BQ92930 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB8BQ92930 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB8BQ92930 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB8BQ92930 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB8BQ92930 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB8BQ92930 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB8BQ92930 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB8BQ92930 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB8BQ92930 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB8BQ92930 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB8BQ92930 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB8BQ92930 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB8BQ92930 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB8BQ92930 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB8BQ92930 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB8BQ92930 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB8BQ92930 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB8BQ92930 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB8BQ92930 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB8BQ92930 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB8BQ92930 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB8BQ92930 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB8BQ92930 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB8BQ92930 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB8BQ92930 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB8BQ92930 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB8BQ92930 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB8BQ92930 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB8BQ92930 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB8BQ92930 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB8BQ92930 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB8BQ92930 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB8BQ92930 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB8BQ92930 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB8BQ92930 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB8BQ92930 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB8BQ92930 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB8BQ92930 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB8BQ92930 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB8BQ92930 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB8BQ92930 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.9 ms