Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSC1Q92574 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TSC1Q92574 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSC1Q92574 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSC1Q92574 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSC1Q92574 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSC1Q92574 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms