Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf40Q8WZ69 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf40Q8WZ69 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf40Q8WZ69 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf40Q8WZ69 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf40Q8WZ69 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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