Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6DQ8NFY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6DQ8NFY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA6DQ8NFY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6DQ8NFY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.4 ms