Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA6DQ8NFY4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6DQ8NFY4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA6DQ8NFY4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA6DQ8NFY4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA6DQ8NFY4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA6DQ8NFY4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA6DQ8NFY4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA6DQ8NFY4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA6DQ8NFY4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA6DQ8NFY4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA6DQ8NFY4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA6DQ8NFY4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA6DQ8NFY4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA6DQ8NFY4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA6DQ8NFY4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA6DQ8NFY4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA6DQ8NFY4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA6DQ8NFY4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA6DQ8NFY4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA6DQ8NFY4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA6DQ8NFY4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA6DQ8NFY4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6DQ8NFY4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA6DQ8NFY4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA6DQ8NFY4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA6DQ8NFY4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA6DQ8NFY4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA6DQ8NFY4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA6DQ8NFY4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA6DQ8NFY4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA6DQ8NFY4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA6DQ8NFY4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA6DQ8NFY4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA6DQ8NFY4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA6DQ8NFY4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA6DQ8NFY4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA6DQ8NFY4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA6DQ8NFY4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA6DQ8NFY4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA6DQ8NFY4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA6DQ8NFY4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA6DQ8NFY4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6DQ8NFY4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA6DQ8NFY4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA6DQ8NFY4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA6DQ8NFY4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA6DQ8NFY4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA6DQ8NFY4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA6DQ8NFY4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA6DQ8NFY4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA6DQ8NFY4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA6DQ8NFY4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA6DQ8NFY4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6DQ8NFY4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEMA6DQ8NFY4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA6DQ8NFY4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA6DQ8NFY4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA6DQ8NFY4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA6DQ8NFY4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA6DQ8NFY4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6DQ8NFY4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6DQ8NFY4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6DQ8NFY4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6DQ8NFY4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6DQ8NFY4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6DQ8NFY4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6DQ8NFY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6DQ8NFY4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6DQ8NFY4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6DQ8NFY4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6DQ8NFY4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6DQ8NFY4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA6DQ8NFY4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA6DQ8NFY4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA6DQ8NFY4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA6DQ8NFY4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA6DQ8NFY4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA6DQ8NFY4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA6DQ8NFY4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA6DQ8NFY4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6DQ8NFY4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6DQ8NFY4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6DQ8NFY4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6DQ8NFY4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6DQ8NFY4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA6DQ8NFY4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6DQ8NFY4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA6DQ8NFY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms