Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2CD4AQ8NCU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C2CD4AQ8NCU7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C2CD4AQ8NCU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C2CD4AQ8NCU7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2CD4AQ8NCU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C2CD4AQ8NCU7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2CD4AQ8NCU7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms