Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL17Q6TDP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL17Q6TDP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL17Q6TDP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL17Q6TDP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL17Q6TDP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.7 ms